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.2012年10月;40(5):1086-9.
doi:10.1042/BST20120088。

LRRK2副重复结构域分析:预测帕金森病突变的重复长度、数量和位点

附属公司
审查

LRRK2辅助重复结构域的分析:帕金森病突变的重复长度、数量和位点的预测

瑞安·D·米尔斯等。 生物化学Soc Trans. 2012年10月.

摘要

各种研究人员已经确定了LRRK2(富含亮氨酸重复激酶2)的主要结构域组织,其中包括一个GTPase ROC(复合蛋白Ras)结构域,然后是一个COR(ROC的C末端)结构域和一个蛋白激酶结构域。此外,由结构重复基序组成的四个结构域可能参与该复合蛋白的调控和定位。在本文中,我们报告了对人类LRRK2氨基酸序列的生物信息学分析,以预测犰狳重复序列、锚蛋白重复序列、富含亮氨酸重复序列和WD40重复序列区域的重复大小、数量和可能的边界。使用具有相似结构域的已知蛋白质结构进行同源建模,以预测这些重复区域的结构、暴露残基和突变位置。我们预测,armadillo重复序列、锚蛋白重复序列和富含亮氨酸的重复序列一起形成了一个由串联重复模块组成的延伸的N端柔性“螺线管”状结构,这可能在锚定膜和细胞骨架结构以及与其他蛋白质配位体结合方面很重要。在LRRK2的C末端附近,WD40重复序列区域预计会形成一个闭合的螺旋桨结构,对蛋白质复合物的形成非常重要。

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