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.2012年7月6日;8(7):1908-20.
doi:10.1039/c2mb25049g。 Epub 2012年5月22日。

HepG2/C3A细胞内部代谢无标签模型的芯片代谢组学和代谢通量分析

附属公司

HepG2/C3A细胞内部代谢无标签模型的芯片代谢组学和代谢通量分析

Djomangan阿达马·瓦塔拉等。 摩尔生物晶体. .

摘要

在生物工程和代谢组学研究中,体外微流体系统越来越多地被用作标准培养皿的替代品,因为它们有望提供接近体内条件的细胞环境。在这项工作中,我们将最近开发的“芯片上代谢组学”方法与代谢流量分析相结合,以建模肝癌HepG2/C3A细胞系的代谢网络,并推断标准培养皿和微流控生物芯片中细胞内代谢流量的分布。在这两个系统中都观察到丙酮酸被高度还原为乳酸,这表明细胞在含氧环境中工作。我们的结果还表明,生物芯片中的HepG2/C3A细胞具有较高的耗氧速率,这可能是由于微流体环境中较高的氧化速率所致。这导致最终糖酵解产物乙酰辅酶a更多地进入克雷布斯循环。这些发现得到了HepG2/C3A细胞在两个系统中的转录活性的支持,因为我们观察到HIF-1(低氧调节因子-1)转录因子调节的基因在Petri条件下过度表达,但在生物芯片中表达的程度较低。

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