Long non-coding RNAs and cancer: a new frontier of translational research?

doi:10.1038/onc.2011.621

审查

.2012年10月25日；31(43):4577-87.

doi:10.1038/onc.2011.621。 Epub 2012年1月23日。

长非编码RNA与癌症：翻译研究的新前沿？

R斯皮佐¹, M I阿尔梅达, 科伦巴蒂, G A Calin公司

附属公司

PMID： 22266873
预防性维修识别码：项目经理3433647
内政部： 1038年10月10日/2011年1月21日

审查

长非编码RNA与癌症：翻译研究的新前沿？

R斯皮佐等。癌基因. 2012.

.2012年10月25日；31(43):4577-87.

doi:10.1038/onc.2011.621。 Epub 2012年1月23日。

作者

R斯皮佐¹, M I阿尔梅达, 科洛姆巴蒂, G A Calin公司

附属

¹实验肿瘤学，意大利PN阿维亚诺IRCSS-国家癌症研究所肿瘤研究中心。

PMID： 22266873
预防性维修识别码：项目经理3433647
内政部： 1038年10月10日/2011年1月21日

摘要

平铺阵列和新的测序技术使整个人类基因组的转录图谱变得可用。然而，转录的程度和发生在蛋白编码基因之外的遗传元素的功能，特别是那些与疾病有关的基因，仍然是一个有争议的问题。在这篇综述中，我们主要关注与癌症有关的长非编码RNA（lncRNAs）。我们定义了lncRNAs，并提出了一个以癌症为导向的lncRNAs列表，列出了一些工具（例如，公共数据库），这些工具对lncRNA进行分类，或扫描感兴趣的基因组跨度，以确定已知的lncRNA是否存在于其中，并描述了lncRNA的一些功能以及癌症中lncRNA表达变化的可能遗传机制，以及lncRNA研究在癌症治疗中的当前和潜在未来应用。

PubMed免责声明

利益冲突声明

利益冲突

作者声明没有利益冲突。

数字

图1
LncRNA的种类和功能。描述了lncRNAs的几种类别和功能。到目前为止，lncRNA的主要功能似乎是调节PCG转录；实际上，lncRNA可以通过改变PCG的染色质状态（例如，通过组蛋白甲基化或乙酰化）来增强或抑制PCG转录。增强子RNA来源于位于靶基因上游数千碱基的增强子元件的转录。增强子DNA既可以通过DNA环路调节基因表达，也可以与目标启动子直接进行DNA-DNA相互作用，还可以转录非多聚A RNA（即eRNA）。eRNA的功能和作用目前尚不清楚。总的来说，长ncRNA（lincRNA、a-ncRNA和AS-ncRNA）和小ncRNA（例如siRNA和miRNA）分别调节蛋白质合成的转录和转录后步骤。在图中所示的编码和非编码转录单元的底部，读者可以找到有关组蛋白修饰的CHIP-seq实验的峰值图：H3K4Me1，组蛋白3赖氨酸4的单甲基化（通常在调节元件附近发现）；H3K4Me3，组蛋白3赖氨酸4处的三甲基化（通常在启动子附近发现）；H3K36Me3，组蛋白3赖氨酸36处的三甲基化（通常在活性转录物附近发现）。

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[3] Kapranov P、Cheng J、Dike S、Nix DA、Duttagupta R、Willingham AT等。RNA图谱揭示了新的RNA类别和普适转录的可能功能。科学。2007;316:1484–1488.-公共医学

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[7] van Bakel H、Nislow C、Blencowe BJ、Hughes TR。大多数“暗物质”转录本与已知基因相关。《公共科学图书馆·生物》。2010;8:e1000371。-项目管理咨询公司-公共医学

[8] van Bakel H、Nislow C、Blencowe BJ、Hughes TR。大多数“暗物质”转录本与已知基因相关。《公共科学图书馆·生物》。2010;8:e1000371。-项目管理咨询公司-公共医学

[9] van Bakel HNC、Blencowe BJ、Hughes TR。对“普遍转录的现实”的回应。《公共科学图书馆·生物》。2011;9:e1001102。-项目管理咨询公司-公共医学

[10] van Bakel HNC、Blencowe BJ、Hughes TR。对“普遍转录的现实”的回应。《公共科学图书馆·生物》。2011;9:e1001102。-项目管理咨询公司-公共医学

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