The structure of human cleavage factor I(m) hints at functions beyond UGUA-specific RNA binding: a role in alternative polyadenylation and a potential link to 5' capping and splicing

doi:10.4161/rna.8.5.16040

审查

.2011年9月至今；8(5):748-53.

doi:10.4161/rna.8.5.16040。 Epub 2011年9月1日。

人类切割因子I（m）的结构暗示了UGUA特异性RNA结合以外的功能：在选择性聚腺苷酸化中的作用以及与5'封盖和剪接的潜在联系

秦阳¹, 格雷戈里·吉尔马丁, Sylvie Doublié

附属公司

PMID： 21881408
预防性维修识别码：下午3256351
内政部： 10.4161/rna.8.5.16040

审查

人类切割因子I（m）的结构暗示了UGUA特异性RNA结合以外的功能：在选择性聚腺苷酸化中的作用以及与5'封盖和剪接的潜在联系

秦阳等。 RNA生物. 2011年9月至今.

.2011年9月至今；8(5):748-53.

doi:10.4161/rna.8.5.16040。 Epub 2011年9月1日。

作者

秦阳¹, 格雷戈里·吉尔马丁, Sylvie Doublié

附属

¹美国弗吉尼亚州伯灵顿佛蒙特大学分子遗传学Markey中心微生物与分子遗传学系。

PMID： 21881408
预防性维修识别码： PMC3256351型
内政部： 10.4161/rna.8.5.16040

摘要

3’末端切割和随后的多聚腺苷化是mRNA成熟的关键步骤。解理发生的精确位置（称为聚（A）位点）由三部分机制决定，其中A（A/U）UAAA六聚体、富含GU的下游元素和UGUA上游元素分别由解理和聚腺苷酸化因子（CPSF）、解理刺激因子（CstF）和解理因子I（m）（CFI（m））识别。CFI（m）由较小的25kDa亚基（CFI（m25）和较大的59kDa、68kDa或72kDa子基组成。CFI（m）68通过其N末端RNA识别基序（RRM）与CFI（m25相互作用。我们最近解决了CFI（m）25与RNA结合的晶体结构和CFI（m25）25复合体、CFI（m2）68的RRM结构域和RNA的晶体结构。我们的研究阐明了CFI复合体识别UGUA的分子基础，提出了一种CFI（m3）介导的选择性聚腺苷酸化的可能机制，并揭示了CFI以及其他mRNA处理因子，如帽结合蛋白（CBP20）的20kDa亚单位和剪接调节器U2AF65。

PubMed免责声明

数字

图2
CFI的序列和结构比较_米68和CFI_米59.（A）CFI的序列比对_米68和CFI_米59个RRM域。相同的残留物以红色突出显示。（B）CFI的保护_米68 RRM是使用ConSurf服务器计算的，并用PyMOL显示。（C） CFI的静电表面电位_米68（左）和CFI_米用Delphi计算59（右）个RRM域，并根据静电势（蓝色，正；红色，负）进行着色。模型与（B）中右侧的模型方向相同。（D） CFI的叠加_米25/CFI公司_米59（PDB ID:3N9U）复合体与CFI_米25/CFI公司_米68（第三季度）。这两个综合体都显示为卡通模型。CFI公司_米25个单体与CFI络合_米59（CFI_米25₅₉)颜色为紫色和粉红色，而CFI_米25个单体与CFI复合_米68（CFI_米25₆₈)有绿色和浅绿色。CFI公司_米59个RRM为金色、黄色和CFI_米68个RRM为蓝绿色。图片左侧的Cleft1因RRM域中的移动而变窄，用橙色弯曲箭头表示。（E）中更详细地显示了灰色矩形所描绘的区域。（E）左视图1的特写视图。CFI的Arg68_米25人与CFI的Glu112参与盐桥_米59（Glu112₅₉)，但相同的精氨酸残基太远，无法与CFI中的类似谷氨酸盐接触_米68（Glu111₆₈). 残留物显示为棒状模型，并根据它们所属的分子进行着色。离子键显示为红色虚线。为了清晰起见，螺旋线显示为圆柱体。

图3
CFI叠加_米68，RRM具有类似形状的环3。CFI公司_米25个单体分别呈绿色和浅绿色。CFI公司_米68 RRM（PDB ID:3Q2S18）呈青色，CBP20（1H2V51）呈红色，U2AF65（2G4B55）呈橄榄色，PAPBC（1CVJ54）呈紫色，Rna15（2X1A40）呈鲑鱼色。

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