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.2011年9月1日;71(17):5891-903.
doi:10.1158/0008-5472.CAN-10-3823。 Epub 2011年7月11日。

肝癌启动子DNA低甲基化景观的定义

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肝癌启动子DNA低甲基化景观的定义

芭芭拉·斯特凡斯卡等。 癌症研究. .

摘要

我们使用最常见的人类癌症之一的肝细胞癌(HCC)作为模型来描述癌症中启动子低甲基化的情况。使用甲基化DNA免疫沉淀和杂交与综合启动子阵列相结合的方法,我们已经鉴定出大约3700个在肿瘤样本中低甲基化的启动子。低甲基化启动子在整个基因组中呈簇状出现,表明癌症的表观基因组变化是由高水平的组织构成的。在正常肝脏中,大多数低甲基化启动子显示出中等水平的甲基化和表达,然而,高CpG密度启动子显示了基因表达的最显著增加。去甲基化基因主要参与细胞生长、细胞粘附和通讯、信号转导、迁移和侵袭;对癌症进展和转移至关重要的功能。DNA甲基化抑制剂5-氮杂-2’-脱氧胞苷激活了一些在肿瘤中被去甲基化和诱导的基因,支持去甲基化在这些基因激活中的因果作用。先前的研究表明,MBD2参与了特定人类乳腺癌和前列腺癌基因的去甲基化。尽管MBD2在正常肝细胞中的缺失几乎没有影响,但我们发现其在人类HCC和腺癌细胞中的缺失导致细胞生长、锚定非依赖性生长和侵袭性的抑制,以及肿瘤中几个低甲基化基因的启动子甲基化和沉默的增加。总之,这些发现确定了低甲基化在癌症中的潜在功能作用。

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