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.2011年6月;23(3):354-9.
doi:10.1016/j.ceb.2011.03.002。 Epub 2011年3月28日。

核组织:对基因表达采取立场

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核组织:对基因表达采取立场

帕梅拉·基耶等。 Curr Opin细胞生物学. 2011年6月.

摘要

真核基因组被分成染色体,染色体占据细胞核内的特定区域或区域。这些染色体区域(CT)的排列基于域的转录活性和染色质景观。一般来说,转录沉默域位于核外围,而活性域位于内部。观察到应激诱导和发育调节的组织特异性基因的核位置变化。一旦激活,这些基因就会从CT转移到含有富含基因表达机制的核体的染色体间空间。基因激活并不总是伴随着运动,因为定位是由许多决定因素决定的,包括基因结构和局部基因组环境。总的来说,组织特异性核组织源于输入的顶点,从而导致适当的转录调控。

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图1
图1
原子核图。(a)核膜由核孔(网篮结构)点缀的内外核膜组成。薄片构成了信封内侧的网状物(格子图案)。在细胞核内,染色体(厚色线)占据特定的区域(相应的有色区域)。染色体上散布着染色体间区域(白色区域)。异染色质主要占据细胞核外围,在染色体区域内显示为较深的斑块。核斑点出现在整个染色体间区域,代表转录因子(黄色)、剪接因子(紫色)、Polycomb蛋白(深红色)和RNA聚合酶(灰色)的积累。(b)LEM域蛋白(灰色)横穿核膜,通过与蛋白屏障自整合因子(BAF;橙色圆圈)的相互作用将染色体(蓝色)连接到核外周,沉默附近的基因(标有黑色X的弯曲箭头)。(c)活性基因(弯曲箭头)被招募到细胞间空间内的转录工厂,该转录工厂富含转录机制、RNA聚合酶(灰色椭圆)、转录因子(黄色圆圈)、剪接因子(紫色圆圈)和RNA转录物(紫色线条)。(d)多梳蛋白结合在分散在整个基因组中的不同位点上,结合形成多梳体(深红色圆圈)。
图2
图2
拴在核膜上的影响。(a)带有LacI结合位点(粉红色条纹)的转基因(粉红色)被插入染色体(粗蓝线)并与相邻的“旁观者”基因一起表达(绿色箭头)。(a))相同的转基因移到核外周的沉默染色质区域(深灰色),并在与LacI-NE蛋白融合蛋白结合后沉默(带黑色X的红色箭头)。(b)插入不同染色体的同一转基因在和之前都表达(b))在每个面板中,格子图案代表核膜,橙色线条代表核膜蛋白,黄色圆圈表示LacI DNA结合域,带条纹的粉红色区域代表LacI结合基序重复;粉色方框代表转基因报告者,粗大的浅蓝线代表染色体,绿色箭头表示活跃基因,红色箭头表示沉默基因。

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