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.2011年5月;44(2):229-55.
doi:10.1017/S0033583510000314。 Epub 2011年3月18日。

分子伴侣Hsp90的构象动力学

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审查

分子伴侣Hsp90的构象动力学

克里斯汀·克鲁肯伯格等。 Q版生物物理. 2011年5月.

摘要

普遍存在的分子伴侣Hsp90占细胞溶质蛋白的1-2%,是真核生物生存所必需的。Hsp90影响多种底物蛋白的折叠和激活,包括许多参与信号传递和调节过程的底物蛋白。其中一些底物与癌症和其他疾病有关,使Hsp90成为一个有吸引力的药物靶点。结构分析表明,Hsp90是一种高度动态和柔性的分子,可以采用多种不同的结构状态。这些重排的一个驱动力是Hsp90固有的ATP酶活性,与其他伴侣一样。然而,与其他伴侣不同,研究表明Hsp90的ATP酶循环不是构象决定的。也就是说,ATP结合和水解不是决定构象状态,而是改变一组预先存在的构象状态之间的平衡。对于细菌、酵母和人类Hsp90,存在一个保守的三态(apo-ATP-ADP)构象循环;然而;状态之间的平衡是物种特有的。在真核生物中,细胞溶质协同伴侣通过改变构象平衡并影响结构变化和ATP水解动力学来调节Hsp90的体内动力学行为。在这篇综述中,我们讨论了导致我们目前理解Hsp90构象动力学的结构和生物化学研究,以及核苷酸、协同伴侣、翻译后修饰和底物所起的作用。通过使用多种互补结构方法,包括结晶学、小角度X射线散射(SAXS)、电子显微镜、Förster共振能量转移(FRET)和核磁共振(NMR),实现了对Hsp90构象动力学的这一观点。最后,我们讨论了Hsp90抑制剂对构象的影响,以及通过破坏构象动力学开发抑制Hsp90的小分子的潜力。

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数字

图1
图1
Hsp90以同二聚体的形式存在,每个单体有三个结构域。细菌同源物HtpG(PDB代码2IOQ)的晶体结构显示为卡通表示和表面表示。单体的结构域为蓝色(NTD)、绿色(MD)和棕色(CTD)。另一单体为灰色。NTD结合核苷酸,包含可变电荷环(红色)和与核苷酸结合囊相邻的保守盖子区域(紫色)。中间结构域包含保守的催化环(氰),对ATP水解至关重要。CTD提供构成二聚体界面。
图2
图2
不同Hsp90同源物的结构域。结构域的颜色为蓝色的N-末端结构域(NTD)、绿色的中间结构域(MD)和棕色的C-末端结构域(CTD)。
图3
图3
Hsp90的全长结构。NTD显示为蓝色,MD显示为绿色,CTD显示为棕色。生物二聚体的第二单体以灰色显示。在所有结构中,暴露的疏水表面以紫色突出显示。A) apo和ADP HtpG结构的表面表示(Shiau等人,2006);2IOQ和2IOP)和酵母AMPPNP结合结构(Ali等人,2006年)。B) apo HtpG溶液状态的表面表征(Krukenberg等人,2008)和Grp94晶体结构(Dollins等人,2007)。
图4
图4
Hsp90的N末端结构域的变异主要发生在眼睑。所有结构均为Hsp90的N末端结构域,盖子以红色或蓝色突出显示。A) 分离的hHsp90 NTD的两种构象(1YER和1YES)。在一个构象(蓝色)环2中,2(L2)延伸到核苷酸结合囊中。在B)来自全长酵母结构的NTD(2CG9)和C)与ADP结合的Grp94的分离NTD(1TBW)中也可以看到盖子中的大运动。D) 在HtpG晶体中观察到三种额外的盖子构象(2IOR、2IOQ和2IOP)。
图5
图5
Hsp90的结构表明存在依赖于核苷酸的构象循环。在这个循环中,ATP的结合将构象从开放结构(1)转移到NTD二聚体封闭结构(3)。Grp94晶体结构(2)可代表并沿此路径或非催化构象居中。ADP的水解导致蛋白质进一步致密(4),核苷酸的释放重新启动构象循环。
图6
图6
MD催化环和相对单体的NTD之间形成疏水相互作用网络。NTD显示为蓝色,MD显示为绿色,CTD显示为棕色。ATP和参与相互作用网络的残基显示为球体,NTD残基显示深紫色,MD残基显示薰衣草色。在展开图中,第二个单体以米色显示。
图7
图7
分子动力学模拟显示,在ATP或ADP存在的情况下,NTD和CTD之间存在不同的远程通信网络。参与远程通讯的残基显示在酵母AMPPNP结合的晶体结构上。NTD显示为蓝色,MD显示为米色,CTD显示为绿色,第二单体显示为灰色。仅在ATP存在的情况下观察到的远距离相互作用显示为紫色。只有ADP存在时才能看到的相互作用以橙色显示。观察到的与ATP和ADP的相互作用显示为深灰色。
图8
图8
孕酮受体和Chk1激酶激活的拟议伴侣循环。孕酮受体(PR)或Chk1首先与Hsp40结合,然后向Hsp70募集。接下来是一个含有Hsp90、Hop和Hsp70的复合体。对于Chk1,这种中间复合物还包括激酶特异性p50。当Hsp70和Hop解离时,形成成熟的复合物。PR的成熟复合体需要附加因子p23的结合。
图9
图9
p23:Hsp90复合物的晶体结构。A) 酵母p23的残基1-134在与全长酵母Hsp90(PDB代码,2CG9)的复合物中结晶。Hsp90的两个单体显示为棕色和绿色,而p23显示为红色。B)ATP结合囊的展开图显示,当存在p23时,活性位点盖(以浅蓝色显示)折叠在结合核苷酸上。这种构造阻止了ATP绑定袋的进出。
图10
图10
p50与Hsp90结合的晶体结构。A) 在晶体中,p50的C末端区域(红色)和Hsp90的NTD(蓝色)形成异四聚体,p50在Hsp90两个NTD结构域之间形成二聚体。B) p50结合与Hsp90闭合状态的二聚NTD不相容。Hsp90的两个NTD以蓝色和米色显示,它们以酵母AMPPNP结合的晶体状态显示。将p50:Hsp90晶体二聚体对接到一个闭合状态的NTD上,可以发现p50(红色)和第二个Hsp90 NTD(米色)之间的空间位阻。C) 来自A的p50:Hsp90异四聚体与来自脱附细菌晶体结构的两个NTD对齐,这表明了阻断Hsp90闭合的机制。apo结构的一个单体以绿色显示,另一个以米色显示。要使Cdc37绑定到此结构,apo状态的NTD必须像蓝色Hsp90 NTD一样移动。
图11
图11
Aha1在裂口边缘结合Hsp90。通过将N-Aha1:MD-Hsp90配合物对接在全长apo(A)和ATP(B)晶体结构上,可以确定Aha1的近似取向。Aha1呈灰色,而Hsp90的一个单体为绿色,另一个为米色。
图12
图12
Aha1与Hsp90的结合导致MD催化环中的重排。A) N-Aha1(灰色)与Hsp90(绿色)MD在络合物中结晶。以红色显示的催化回路在晶体结构中是部分无序的。B) 与Aha1:Hsp90复合物相比,apo全长结构(米色)中的催化环具有更多的α-螺旋结构,催化所需的R380(以棒状显示)与apo结构中的MD形成接触。C) 在封闭的AMPPNP结合晶体结构中,紫色显示的催化环将R380定向于NTD,在NTD中与ATP的γ-磷酸盐相互作用。Aha1:Hsp90复合体中的环结构与闭合状态下的环结构密切相关。
图13
图13
Hsp90:p50:Cdk4复合物形成的建议模型。最初,激酶Cdk4与p50的二聚体结合。然后将该复合物招募到Hsp90的二聚体中,形成对称复合物。发生构象重排,p50的一个单体发生位移,导致EM观察到的不对称络合物。

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