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.2011年1月至4月;2(1):23-31.
doi:10.1002/wrna.47。

真核生物中mRNA多聚腺苷酸替代:基因表达的有效调节器

附属公司
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真核生物中mRNA多聚腺苷酸替代:基因表达的有效调节器

卡罗尔·卢茨等。 Wiley Interdiscip Rev RNA. 2011年1月至4月.

摘要

替代RNA加工机制,包括替代剪接和替代多聚腺苷化,越来越被认为是基因表达的重要调节器。这篇文章将重点介绍最近关于高等真核生物发育、分化和疾病中选择性聚腺苷酸化的描述。我们还将描述检测细胞转录组(实验和生物信息学)的不断发展的全球方法如何揭示替代3'末端形成的复杂性质以及与其他RNA介导和RNA处理机制的相互作用的新细节。

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图1
图1
聚腺苷酸化事件示意图。浅蓝色方框,未翻译区域;深蓝色方框,编码区域;行,内含子。I型多聚腺苷酸化的mRNA在最外显子3′处只有一个多聚腺苷酸化信号。具有II型多聚腺苷酸化的mRNA在最外显子3′处有一个以上的多聚腺苷酸化信号。III型聚腺苷酸化是与选择性聚腺苷酸化偶联的选择性剪接;IIIi型信号在上游内含子中有一个或多个多聚腺苷化信号;IIIe型信号在上游外显子中有一个或多个多聚腺苷化信号。
图2
图2
3′UTR中存在的许多RNA顺式作用元件可以影响多聚腺苷化以及其他RNA加工或RNA介导的事件,并且这些作用是相互交织的。3′UTR对基因表达的调节取决于顺式-作用调节元件,可能影响核和细胞质多聚腺苷化(pA信号和c(c)细胞增殖的第页聚腺苷酸化e(电子)元素(CPE)、mRNA产生的稳定性(例如由AU元素产生)、mRNA的亚细胞定位以及翻译或mRNA衰变。此外,3′UTR中microRNA靶点的存在可能会影响基因表达。存在反式-在特定阶段和正确浓度下,与这些元素或靶向细胞或组织中mRNA的microRNA结合的作用因子对调节的发生至关重要。3′UTR中的选择性多腺苷酸化产生不同的信使核糖核酸亚型,含有不同的顺式-作用元件。改编自Conne等人,2000年(经作者许可)。
图3
图3
如图中央所示,mRNA的选择性多聚腺苷化可能影响许多其他细胞或生物体事件。详见正文。

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