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.2010年12月10日;285(50):39551-63.
doi:10.1074/jbc。M110.114736。 Epub 2010年10月4日。

微RNA(miRNA)介导的白血病/淋巴瘤相关因子(LRF)和选择性剪接因子/剪接因子2(ASF/SF2)相互作用影响小鼠胚胎成纤维细胞衰老和凋亡

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微RNA(miRNA)介导的白血病/淋巴瘤相关因子(LRF)和选择性剪接因子/剪接因子2(ASF/SF2)相互作用影响小鼠胚胎成纤维细胞衰老和凋亡

洛雷娜·威尔杜西等。 生物化学杂志. .

摘要

白血病/淋巴瘤相关因子(LRF)是一种转录阻遏物,通过招募组蛋白脱乙酰化酶特异性抑制p19/ARF表达,从而发挥癌基因的作用。相反,在小鼠胚胎成纤维细胞(MEF)中,LRF抑制导致p19ARF异常上调,导致增殖缺陷和过早衰老。我们最近发现LRF是由microRNA控制的。在这里,我们表明LRF通过抑制miR-28和miR-505作用于MEF增殖和衰老/凋亡,揭示了小RNA(miRNAs)在LRF上游和下游都起作用的调节电路。通过分析转染LRF特异性短干扰RNA的MEF的miRNA表达谱,我们发现miR-28和miR-505受到LRF的调节。据预测,这两种miRNA都靶向选择性剪接因子/剪接因子2(ASF/SF2),这是一种对细胞活力至关重要的丝氨酸/精氨酸蛋白。在脊椎动物中,ASF/SF2的缺失或失活可能导致基因组不稳定,并诱导G(2)细胞周期阻滞和凋亡。我们发现miR-28和miR-505通过直接结合ASF/SF2 3'-UTR来调节ASF/SF2。LRF降低导致ASF/SF2降低,这取决于miR-28和miR-505的上调。LRF/miR-28/miR-505/ASF/SF2轴各成员的改变影响MEF增殖以及衰老和凋亡细胞的数量。一直以来,随着MEF培养中细胞衰老的增加,轴受到协调调节。总之,我们发现LRF-依赖性miRNAs miR-28和miR-505通过靶向ASF/SF2控制MEF增殖和存活,并提示LRF-相关miRNAs-除了LRF-依存性p53控制的作用外,在细胞内稳态中还发挥着中心作用。

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数字

图1。
图1。
LRF下调修饰MEF中的全球miRNA谱。 ,P2MEF细胞转染siRNA-LRF和干扰siRNA(siRNA-Ct). 为了验证转染的效果,通过Western blot测定LRF蛋白水平(左侧面板). 作为进一步的对照,进行qRT-PCR以测量LRF公司及其直接目标第19页ARF(右侧面板). 将从转染细胞中提取的RNA手动杂交到8.1版Exiqon miRCURY LNA阵列。bqRT-PCR分析进一步验证了5个Z-score>3 S.D.阳性的miRNA。U6用于数据归一化。qRT-PCR分析中报告的值是三个独立转染实验的平均值。**,第页< 0.01; ***,第页< 0.001.
图2。
图2。
LRF减少影响磅/平方英寸附件11c基因。 b,miRNA定位和推测LRF结合位点的示意图磅/平方英寸()以及ATP 11c(b)基因。灰色方块、LRF结合位点。这个虚线图中显示了CpG岛的位置,该岛的跨度从−700到+500ATP11c型基因(b). 用siRNA-LRF和siRNA-Ct转染MEF。c(c),48小时后,提取总RNA,并进行qRT-PCR以定量ATP11c型磅/平方英寸抄本。d日转染LRF表达载体的HEK293细胞中的转表达分析磅/平方英寸基于启动子荧光素酶的载体雷尼利亚向量作为内部控制。顶部,在转染48小时后使用双荧光素酶报告分析系统测定启动子活性。底部,WT示意图并删除磅/平方英寸荧光素酶报告载体中克隆的启动子。e(电子),用siRNA-LRF或siRNA-Ct转染HEK293细胞磅/平方英寸启动子萤光素酶载体雷尼利亚向量作为内部控制。所有实验均一式三份。**,第页< 0.01; ***,第页< 0.001.
图3。
图3。
miR-28和miR-505通过直接结合其3′-UTR下调ASF/SF2。 ,小鼠Sfrs1基因剪接变异体的示意图。描述了miR-28和miR-505的假定结合位点。顶部,的虚线双箭头显示了3′-UTR的克隆部分。底部,包含Sfrs1变异体1的3′-UTR的基因组区域的系统发育保守性。Vista用于在小鼠和人类的基因组序列之间进行成对比对。b,P2MEF转染80 nmiR-Ct、miR-28和miR-505。然后,在转染48 h后提取蛋白质,并进行ASF/SF2和微管蛋白的Western blot作为内部对照。顶部这是西方污点的一个例子。底部,如上所述进行的三个实验的密度计定量。带强度归一化为微管蛋白的带强度。c(c),P2MEF用80n转染诱饵-Ct(d-Ct(d-Ct))、d-28和d-505。底部,提取蛋白质并通过Western blot进行分析,如b.顶部这是西方污点的一个例子。d日、转染ASF-UTR载体的HK293细胞中的相对GFP荧光(EGFP-C1载体包含GFP基因融合到WT ASF/SF2 3′-UTR)、mut-28和mut-505(分别包含在miR-28和miR-505的种子匹配中突变的ASF/SV2 3′-UTR)。*,第页< 0.05; **,第页< 0.01; ***,第页< 0.001.
图4。
图4。
LRF通过miR-28和miR-505调节调节ASF/SF2。 用siRNA-LRF和siRNA-Ct转染MEF。48 h后,评估LRF和ASF/SF2蛋白水平。b,MEF与si-Ct、siRNA-LRF+d-Ct、siRNA-LRF+d-28或siRNA-LF+d-505联合转染。顶部底部48小时后,提取蛋白质和LRF(顶部)和ASF/SF2(底部)被量化。数据是三个实验的平均值。用对照质粒转染MEF(pCMV公司)和LRF表达载体(对LRF)使用Amaxa核电穿孔装置。纳秒,不显著。c–e类48小时后,LRF和ASF/SF2蛋白质水平(c(c))、LRF和ASF/SF2亚型1 mRNA水平(d日)和miRNA水平(e(电子))进行了评估。*,第页< 0.05; **,第页< 0.01; ***,第页< 0.001.
图5。
图5。
在培养的MEF连续传代过程中,LRF/miR-28/miR-505/ASF/SF2轴被调制。 MEF传代中LRF和p19ARF的Western blot密度定量和qRT-PCR定量。bc(c),Western blot的密度定量(b)和qRT-PCR定量(c(c))在MEF通道中的ASF/SF2。b,顶部ASF/SF2的Western blot分析示例。d日e(电子),qRT-PCR定量miRNA(d日)以及磅/平方英寸附件11cMEF通过期间的抄本(e(电子)).
图6。
图6。
LRF/miR-28/miR-505/ASF/SF2轴失调的生物学后果。 a–f,P2MEF转染siRNA-Ct,siRNA-LRF(),siRNA-ASF(b),miR-28(c(c)),miR-505(d日)、d-Ct和d-28(e(电子))和d-505((f)). 48小时后,将细胞进行胰蛋白酶化并接种进行“实验程序”中所述的不同分析。“图表显示了增殖、衰老和凋亡细胞数量的倍数变化(阴性和阳性)。每个值都是通过除以si-LRF转染的细胞百分比获得的(),si-ASF/SF2(b),miR-28(c(c))和miR-505(d日)用si-Ct转染的细胞或用d-28转染细胞的百分比进行分割的细胞(e(电子))和d-505((f))转染d-Ct的细胞a–d根据siRNA-Ct计算,而e(电子)(f)根据d-Ct.*计算,第页< 0.05; **,第页< 0.01; ***,第页< 0.001.
图7。
图7。
miR-28和miR-505过度表达对Ich-1和Bcl-x选择性剪接的调节。 d日,Ich-1替代拼接的示意图()和Bcl-x(d日)基因。用siRNA-Ct、miR-28和miR-505转染P2MEF。48小时后,提取总RNA并制备cDNA。可选拼接Ich-1(b)和Bcl-x(e(电子))用小鼠特异性引物对产物进行RT-PCR检测。底火位置由小箭头在中下部属于面板ad.抄送(f),三个实验的密度定量,如中所述be(电子)。值表示为S/L比,并使用Optiquant程序获得。*,第页< 0.05; **,第页< 0.01.纳秒,不显著。S公司短亚型和长亚型。
图8。
图8。
LRF/miR-28/miR-505/ASF/SF2轴的拟定作用(修改自参考文献8)。LRF上调或下调所诱导的miR-28和miR-505的调节影响ASF/SF2水平,并加强LRF在MEF增殖、衰老和凋亡中的作用。虚线表示失去压制。较小的表单表示蛋白质/miRNA减少。

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引用人

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