Mutations in TPRN cause a progressive form of autosomal-recessive nonsyndromic hearing loss

doi:10.1016/j.ajhg.2010.02.003

.2010年3月12日；86(3):479-84.

doi:10.1016/j.ajhg.2010.02.003。 Epub 2010年2月18日。

TPRN突变导致进行性常染色体隐性遗传非综合征性聋

李云（Yun Li）¹, 埃丝特·波尔, Redouane Boulouiz公司, 马吉特·施拉德斯, 古德伦·纽恩堡, 马吉达·查里夫, 罗纳德·J·C·海军上将, 西蒙·冯·阿梅隆, 英格洛尔·贝斯曼, 莫斯塔法·坎迪尔, 乔里斯·安·维尔特曼, 彼得·纽恩伯格, 克里斯蒂安·库比什, 阿卜杜勒哈米德·巴拉卡特, 汉尼·克莱默, 伯恩德·沃尔尼克

附属公司

PMID： 20170898
预防性维修识别码：项目经理2833376
内政部： 2016年10月10日/j.ajhg.2010.02.003

TPRN突变导致进行性常染色体隐性遗传非综合征性聋

李云（Yun Li）等。美国人类遗传学杂志. 2010.

.2010年3月12日；86(3):479-84.

doi:10.1016/j.ajhg.2010.02.003。 Epub 2010年2月18日。

作者

附属

¹科隆大学科隆分子医学中心（CMMC），德国科隆50931。

PMID： 20170898
预防性维修识别码：项目经理2833376
内政部： 2016年10月10日/j.ajhg.2010.02.003

摘要

我们对一个来自摩洛哥的血缘大家族进行了全基因组纯合子定位，并将该家族中的常染色体隐性非综合征性耳聋（ARNSHL）定位到染色体9q34上的DFNB79位点。通过对关键区域62个位置候选基因的测序，我们在所有7名受影响个体的TPRN基因中发现了一个致病性纯合11 bp缺失，即c.42_52del。缺失位于外显子1，导致移码和蛋白质过早截断（p.Gly15AlafsX150）。有趣的是，被删除的序列是重复且富含CG的动机的一部分，预计在交叉形成期间容易出现结构畸变。我们发现另一个与该基因座相关的进行性ARNSHL家族，其受影响的成员在TPRN的外显子1中携带1 bp的致病性缺失（c.1347delG）。编码蛋白taperin的功能未知；然而，与肌动蛋白phostensin的部分同源性表明了肌动蛋白动力学的作用。

PubMed免责声明

数字

图1
SF40系列与*DFNB79型*基因座（A）SF40家族单倍型分析显示*DFNB79型*染色体9q34上的位点。（B）个人IV-3（24岁）和IV-4（21岁）的空气（蓝色）和骨（红色）传导纯音测听声像图。（C） 10K阵列SNP基因分型后全基因组LOD评分计算的示意图。使用ALLEGRO计算的LOD分数沿年相对于cM基因组位置的轴x个轴。请注意染色体9q上端粒区域的最高峰值。（D）染色体9q34区域的基因组概述和使用的微卫星标记的基因组定位。黑色条表示所描述的*DFNB79型*与SF40和W07-234家族中确定的关键区域的比较。

图2
中突变的鉴定*TPRN（TPRN）*两个ARNSHL家族（A和C）序列色谱图显示*TPRN（TPRN）*基因。（A）如方框所示，纯合子c.42_52del突变影响重复动机。通过PCR扩增和4%琼脂糖凝胶分离，分析了SF40家族17个成员的c.42_52del突变的基因型。显示碎片大小。上部带代表异源双链片段。（B）微卫星标记的单倍型*DFNB79型*荷兰W07-234家系两名患者在不同时间点的区域和听力图，显示听力损伤的进展。（C）在W07-234家族中鉴定的纯合C.1347delG突变与正常野生型序列的比较色谱图。突变去除了*BsmFI公司*使用基因芯片分析父母和受突变影响的兄弟姐妹的基因型*BsmFI公司*PCR扩增后消化。在1%琼脂糖凝胶上分离限制性片段，得到野生型的四个片段（361 bp、317 bp、229 bp和80 bp）和纯合突变体的三个片段（677 bp、299 bp和80bp）。

图3
*TPRN（TPRN）*结构和表达式（A）所描述的*TPRN（TPRN）*转录物（NM_001128228.1，NM_173691.3），TPRN蛋白的编码氨基酸（NP_775962.2，NP_001121700.1），以及已鉴定突变的位置。（B和C）分析*TPRN（TPRN）*通过RT-PCR在P2小鼠和人胎儿耳蜗不同组织中的表达（gDNA，基因组DNA；C，水对照）。小鼠RT-PCR的PCR引物定位于小鼠的外显子1（正向，5′-TCTGACACAGAAGTGTTAGG-3′）和外显子2（反向，5′-CAGAGAGCTCAGAGGTAC-3′）*TPRN（TPRN）*人胎儿耳蜗RT-PCR引物位于外显子3（正向，5′-CTCAGGCCTGTCCAGCTACA-3′）和外显子4（反向，5′-AGTGCGGCTCAGAAATAC-3′）。

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1. Mehl A.L.，Thomson V.新生儿听力筛查：重大遗漏。儿科学。1998;101:E4。-公共医学
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1. Dror A.A.，Avraham K.B.听力损失：遗传学和细胞生物学揭示的机制。每年。修订版Genet。2009;43:411–437.-公共医学
1. Brown S.D.、Hardisty-Hughes R.E.、Mburu P.《安静如鼠：剖析听觉的分子和遗传基础》，《自然评论遗传学》。2008;9:277–290.-公共医学

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