Eating at the table of another: metabolomics of host-parasite interactions

doi:10.1016/j.chom.2010.01.008

审查

.2010年2月18日；7(2):90-9.

doi:10.1016/j.chom.2010.01.008。

与他人共进晚餐：主-辅相互作用的代谢组学

比约恩·F·C·卡夫萨克¹, 曼努埃尔·利亚斯

附属公司

PMID： 20159614
PMCID公司：项目经理2825149
内政部： 2016年10月10日/j.chom.2010.01.08

审查

与他人共进晚餐：主-辅相互作用的代谢组学

比约恩·F·C·卡夫萨克等人。宿主与微生物. 2010.

.2010年2月18日；7(2):90-9.

doi:10.1016/j.chom.2010.01.008。

作者

比约恩·F·C·卡夫萨克¹, 曼努埃尔·利亚斯

附属

¹美国新泽西州普林斯顿大学路易斯·西格勒综合基因组研究所，邮编08544。

PMID： 20159614
PMCID公司：项目经理2825149
内政部： 2016年10月10日/j.chom.2010.01.08

摘要

代谢组学（代谢产物水平的全球分析）在原生动物寄生虫研究中的应用，已成为了解宿主-寄生虫关系的重要工具，并有望开发急需的治疗方法和改进诊断方法。过去十年的研究进展为利用代谢组学研究原生动物寄生虫的系统生物学方法打开了大门，提供了代谢活动的重要读数。在这篇综述中，我们重点介绍了原生动物寄生虫的代谢组学方法，包括代谢产物分析、与基因组学的整合、转录和蛋白质组分析，以及利用代谢指纹诊断寄生虫感染。

PubMed免责声明

数字

**图1。代谢组学中常用的方法**
上图概述了代谢组学实验的主要步骤，以及每个步骤的一些常用选项。在样品处理之前，可以对感兴趣的生物材料进行同位素富集，以跟踪标记化合物随时间的代谢。一些技术，如核磁共振（NMR）波谱，允许监测活生物体内的代谢物或直接分析整个裂解物，但通常通过将取样材料限制在特定生物流体（例如尿液、血浆）中来降低样品复杂性或进行溶剂萃取（例如甲醇/水、甲醇/氯仿、高氯酸盐）。此外，质谱（MS）和光谱（红外（IR）或紫外（UV））方法通常利用色谱法（气相色谱（GC）、液相色谱（LC）、高效液相色谱法（HPLC））或毛细管电泳（CE）来限制任何时候进入检测器的样品复杂性，并确定特征保留时间。质谱法利用给定代谢物的保留时间以及质量/电荷比（MS），通常与串联质谱（MS/MS）中碎片子离子的质量/电荷比率相结合，进行鉴定。核磁共振利用适当原子核（例如。¹H、，¹³C、，³¹P）用于代谢物鉴定。光谱法在代谢物的个体识别方面表现不佳，但在确定样品的整体代谢谱或指纹变化方面，它是一种更具成本效益的方法。核磁共振和质谱方法不仅可以检测数十到数百种单独的代谢物，而且最近的进展还允许更准确地测量代谢物浓度，这对于确定代谢网络中的代谢体流量至关重要。

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[7] Angulo S、Garcia-Perez I、Legido-Quigley C、Barbas C。CE代谢指纹识别后的生物化学关系自相关矩阵。电泳。2009;30:1221–1227.-公共医学

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