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.2009年6月；8(6):1338-49.
doi:10.1074/mcp。M800453-MCP200。 Epub 2009年2月6日。

用蛋白质组和基因组生物标记物评估年龄相关性黄斑变性的易感性

嘉荫顾 1, 盖尔·J·T·鲍尔, 岳秀珍, 乌马德维·纳伦德拉, 格温·M·斯特吉尔, 詹姆斯·贝纳, 顾晓荣, 尼尔·S·皮奇, 罗伯特·G·所罗门, 斯蒂芬妮·哈格斯特罗姆, 约翰·W·克拉布; 临床基因组和蛋白质组AMD研究小组
合作者，附属公司

用蛋白质组和基因组生物标记物评估年龄相关性黄斑变性的易感性

嘉荫顾等。 分子细胞蛋白质组学. 2009年6月.

摘要

老年性黄斑变性（AMD）是一种进行性疾病，是严重视力丧失的主要原因。为了发现早期识别AMD敏感性的工具，我们评估了蛋白质组和基因组AMD生物标记物的联合预测能力。我们通过ELISA定量了916例AMD和488例对照供体的血浆羧乙基吡咯（CEP）氧化蛋白修饰和CEP自身抗体。CEP加合物是由视网膜中丰富的二十二碳六烯酸类脂质氧化而生成的。AMD血浆中CEP加合物和自身抗体的平均水平分别升高约60%和30%。AMD患者两个CEP标记物升高的比值比是对照组患者的3倍或更多。对与年龄相关性黄斑病变易感性2（ARMS2）、高温需求因子A1（HTRA1）、补体因子H和补体C3相关的AMD风险多态性进行基因分型，并根据基因型单独或与CEP标记物联合预测AMD风险。对于CEP标记物和风险基因型升高的患者，预测的AMD风险是仅基于基因型的风险的2-3倍。携带ARMS2和HTRA1风险等位基因的AMD捐赠者最有可能出现CEP标记升高。结果令人信服地表明，AMD血浆中CEP标记物的平均水平在较大年龄范围内较高。受试者操作特征曲线表明，仅CEP标记物就能区分AMD和对照血浆供体，准确率约为76%，结合基因组标记物可提供高达80%的鉴别准确率。血浆CEP标记物水平因一些人口统计学和健康因素而略有改变，值得进一步研究。我们得出的结论是，CEP血浆生物标志物，特别是与基因组标志物相结合，为评估这种致盲的多因素疾病的易感性提供了一个潜在的预警系统。

PubMed免责声明

数字

F<sc>ig</sc>。1
F类免疫球蛋白. 1.
在AMD血浆中CEP加合物和自身抗体升高。CEP加合物浓度(一)和自身抗体滴度(B类)用ELISA从对照组中定量(n个=488）和AMD(n个=916）血浆捐献者的结果显示为中位数（）±第一和第三四分位数(第一季度,第3季度)平均（○）结果±S.D。第页值（双面t吨试验）由对数转换浓度测定。表一按AMD进展分类列出了这些数据。对照组显示CEP加合物水平与自身抗体滴度之间的相关性(C类)和AMD(D类)与水平的和垂直虚线指示中间控制值。AMD患者中CEP标记物升高的供体明显多于对照组(右上象限在里面C类和D类).
F<sc>ig</sc>。2
F类免疫球蛋白. 2.
CEP加合物AMD和对照血浆的Western分析。对人AMD和对照供体血浆样品进行SDS-PAGE（～15μg/泳道），电印迹到PVDF，并用小鼠单克隆抗CEP抗体探测。CEP加合物（免疫反应性）在1分钟放射自显影后显示与高分子量组分（>～40 kDa）相关(一)60分钟放射自显影后，成分也为～25 kDa(B类). 随着放射自显影时间的延长，其他成分变得明显。所示条带中CEP免疫反应的密度定量支持AMD中CEP加合蛋白比正常供体血浆中更多(第页值来自双面t吨测试）。误差线反映标准偏差。考马斯蓝染色凝胶(C类)结果表明，在Western分析中，每条车道上施用的蛋白质量大致相等。列出了每个供体的年龄和性别，对于AMD样本，星号（*）和#符号分别表示有CNV或地理萎缩的供体。F类，女性；M（M），男。
F<sc>ig</sc>。三。
F类免疫球蛋白. 3.
通过CEP标记物和基因型预测AMD风险。 一仅基于CEP标记升高的AMD风险优势比，仅基因型（纯合子风险等位基因特有ARMS2系统,HTRA1型,CFH公司和C3类)所有AMD均显示了两者的联合效应(一)和高级AMD(b条)患者。B类所有AMD或晚期AMD患者的AMD风险基因型和非风险纯合子基因型中CEP标记物的比值比均升高。纯合风险和非风险供体之间CEP标记物浓度的差异具有统计学意义（**，第页< 0.01; *,第页< 0.05; Fisher精确测试）ARMS2系统和HTRA1型但不是为了CFH公司和C3类样本大小、基因频率、OR和95%CI，以及第页值如表III、IV和VI所示。OR、95%CI和第页用对数转换CEP标记物浓度测定值。
F<sc>ig</sc>。4
F类免疫球蛋白. 4.
血浆CEP加合物和自身抗体（按供体年龄）。血浆CEP加合物(一)和CEP自身抗体水平(C类)AMD组和对照组按供者年龄绘制。皮尔逊相关分析(水平彩色编码线和第页来自对数转换数据的值）显示，除了对照队列中CEP自身抗体滴度逐渐增加外，平均CEP标记物浓度随年龄的变化很小。CEP加合物(B类)和CEP自身抗体水平(D类)AMD组和对照组供体按年龄组绘制，包括≤50岁的对照组(年) (n个=98），51–60岁(n个=138控制，n个=26 AMD），61–70岁(n个=153控制，n个=123 AMD），71–80岁(n个=154控制，n个=389 AMD），且>80岁(n个=43控制，n个=378 AMD）-对照组和AMD组之间的CEP标记物浓度存在折叠差异。星号反映第页双边值t吨测试（***，第页< 0.001; **,第页< 0.01; 和*，第页< 0.05).误差线反映标准偏差。
F<sc>ig</sc>。5.
F类免疫球蛋白. 5.
血浆CEP标记物按人口统计学和健康因素分层。AMD和对照研究人群中的血浆CEP加合物和CEP自身抗体水平根据捐赠者的种族、性别、吸烟状况、高血压、高脂血症、糖尿病和心血管疾病状况绘制。标明每组的样本量，以及星号反映第页双边值t吨对数转换的CEP标记物浓度的测试（***，第页< 0.001; **,第页< 0.01; 和*，第页< 0.05).考克，白种人；非洲裔美国人，非裔美国人；F类，女性；M（M），男性；S公司、吸烟；NS公司，不吸烟；w个，具有；没有，没有。误差线反映标准偏差。
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