LSD1 and the chemistry of histone demethylation

doi:10.1016/j.cbpa.2007.07.014

审查

。2007年10月；11(5):561-8.

doi:10.1016/j.cbpa.2007.07.014。 Epub 2007年9月11日。

LSD1与组蛋白去甲基化化学

杰弗里·库哈内¹, 菲利普·科尔

附属公司

PMID： 17851108
预防性维修识别码：项目经理2112775
内政部： 2016年10月10日/j.cbpa.2007.07.014

审查

LSD1与组蛋白去甲基化化学

杰弗里·库哈内等。当前操作化学生物。 2007年10月。

。2007年10月；11(5):561-8.

doi:10.1016/j.cbpa.2007.07.014。 Epub 2007年9月11日。

作者

杰弗里·库哈内¹, 菲利普·科尔

附属

¹美国马里兰州巴尔的摩约翰霍普金斯医学院药理学和分子科学系，邮编21205。

PMID： 17851108
预防性维修识别码：项目经理2112775
内政部： 2016年10月10日/j.cbpa.2007.07.014

摘要

最近发现组蛋白去甲基化可由黄素依赖性胺氧化酶LSD1催化，这一发现为染色质重塑社区开辟了新的篇章。在此，我们讨论了组蛋白去甲基化酶领域的快速进展，包括非血红素铁依赖性组蛋白去甲化酶（JmjC家族）的最新鉴定，LSD1底物位点特异性的基础，以及在结构和功能分析中抑制这些酶的新潜力。

PubMed免责声明

数字

**图1。脱甲基酶的催化机理**
**（a）**组蛋白H3的Lys-4的FAD依赖性去甲基化通过亚胺离子的水解进行，随后胺被黄素双电子氧化。R=核糖腺嘌呤二核苷酸**（b）**三甲基赖氨酸底物的铁（II）依赖性去甲基化通过铁（Ⅱ）、α-酮戊二酸和O进行₂甲基C-H键的衍生羟基自由基氧化。

**图2。基于机制的LSD1失活**
**（a）**含有H3肽的N-甲基丙炔胺通过黄素N的共轭加成来灭活LSD1的拟议机制⁵在双电子氧化为亚胺离子后，电泳剂的γ-碳。**（b）**用NaBH还原FAD活化剂共轭物的三甲烯键₄是晶体研究所必需的。**（c）**所提出的催化机理是通过自由基重组和随后的脱水，在胺上进行单电子氧化和开环，来实现tranylcypromine对LSD1的失活。R=a-c中的核糖腺嘌呤二核苷酸

**图3。LSD1激活剂晶体结构揭示的LSD1底物特异性**
**（a）**Asp-556和Ala-1（H3肽的N末端）之间的关键相互作用的活性位点视图，以及Trp-552和Asp-555与H3肽Arg-2之间的关键交互作用。**（b）**H3肽骨架在Arg-2和Lys-4、Thr-3和Gln-5以及Lys-4和Thr-6之间采用的三个连续伽玛旋转构型的活性位点视图。**（c）**呈现包含三个连续伽玛旋转的H3肽，以说明由我,我+2主链氢键。

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