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.2006年8月;17(8):3521-33.
doi:10.1091/mbc.e05-10-0946。 Epub 2006年6月14日。

异质核核糖核蛋白(hnRNP)E1与hnRNP A2结合并抑制A2反应元件mRNA的翻译

附属公司

异质核核糖核蛋白(hnRNP)E1与hnRNP A2结合并抑制A2反应元件mRNA的翻译

琳达·D·科斯图尔科等。 分子生物学细胞. 2006年8月.

摘要

异质核核糖核蛋白(hnRNP)A2是一种反式作用的RNA-结合蛋白,可介导含有顺式A2反应元件(A2RE)的RNAs的转运。先前的研究表明,A2RE RNA被转运到少突胶质细胞的髓鞘和神经元的树突。hnRNP E1是一种调节特定mRNA翻译的RNA结合蛋白。这里,我们通过酵母双杂交分析、体内和体外共免疫沉淀、体外交联和荧光相关光谱显示,hnRNP E1与hnRNP A2结合,并以hnRNP A2-依赖的方式招募到A2RE RNA。hnRNP E1与少突胶质细胞树突颗粒中的hnRNP A2和A2RE mRNA共定位。在神经细胞中过度表达hnRNP E1或微量注射外源性hnRNP El会抑制A2RE mRNA的翻译,但不会抑制非A2RE RNA的翻译。在体外翻译系统中添加过量的hnRNP E1会以hnRNP A2依赖的方式降低A2RE mRNA的翻译效率,但不会降低非A2RE RNA的转换效率。这些结果与一个模型一致,即hnRNP E1通过与hnRNP A2结合而被招募到A2RE RNA颗粒中,从而在颗粒转运过程中抑制A2RE RNA的翻译。

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数字

图1。
图1。
hnRNP E1–hnRNP A2交互。(A) 协同免疫沉淀:体外翻译产物。体外合成[35S] 甲硫氨酸标记的hnRNP A2与5倍摩尔过量的hnRNP A2-HA或hnRNP E1-25-HA组合,并用抗HA抗体沉淀混合物。沉淀用SDS-PAGE分离;将凝胶固定、干燥并暴露在x射线胶片上。(B) 协同免疫沉淀:体内内源性产物。少突胶质细胞匀浆与兔抗hnRNP E1或正常兔血清(NRS)孵育。免疫沉淀物用蛋白A结合琼脂糖珠分离,用SDS-PAGE分离,并用小鼠抗hnRNP A2进行蛋白质印迹分析,以检测hnRNP A2。右通道是免疫沉淀前的一份匀浆。(C) 生物素转移试验:将与磺化-SBED偶联的hnRNP A2(A2)与hnRNP E1(E1)、BSA或不加任何添加剂混合,并进行(+)或(-)UV交联。还原后,用SDS-PAGE分析蛋白质混合物,将其印在PVDF膜上,并用链霉亲和素-辣根过氧化物酶(top)进行检测。通过SDS-PAGE分析相应的部分,并用考马斯蓝(底部)染色。分子量标记显示在左侧。
图2。
图2。
通过互相关FCS分析hnRNP E1到A2RE RNA的hnRNP A2依赖性招募。用Alexa Fluor 647标记的重组hnRNP E1在存在(闭合圈)或不存在(开放圈)未标记的hnRNP A2(10 nM)的情况下与含有12份A2RE序列(5 nM)拷贝的合成RNA孵育。在存在(闭合三角形)或不存在(开放三角形)未标记hnRNP A2(10 nM)的情况下培养类似标记的hnRNP E1,对照非A2RE RNA(5 nM)用Alexa Fluor 488标记。包括未标记tRNA(250 nM)以减少非特异性结合。通过双通道交叉相关FCS测定hnRNP E1向RNA的招募。
图3。
图3。
HnRNP E1/E2与A2RE RNA颗粒的相关性。培养的少突胶质细胞经CSK提取、固定,并用小鼠抗hnRNP A2(1:200)(绿色通道)(A)和兔抗hnRNP1/E2(1:50)(红色通道)(B)进行免疫染色。插入B中,树突远端的高倍放大。黄色表示绿色和红色强度的空间重合。将培养的少突胶质细胞微量注射荧光标记的A2RE RNA(绿色)(D),并用抗hnRNP E1/E2(红色)(E)染色。插入D中,树突中间部分的高倍放大。测量每个通道(A和B、D和E)中分辨率良好的颗粒的荧光强度,并根据代表性实验绘制(分别为C和F)。每个点代表一个颗粒。棒材,15μm。
图4。
图4。
hnRNP E1过度表达对翻译的影响。(A) 注射GFP-A2RE RNA的B104细胞。(B)注射hnRNP E1 cDNA和GFP-A2RE RNA的B104细胞。(C)注射GFP-A8G RNA的B104细胞;(D) B104细胞注射hnRNP E1 cDNA和GFP-A8G RNA。所有RNA均为聚腺苷酸,所有注射混合物均含有Alexa Fluor 546-共轭葡聚糖。新合成的GFP在绿色通道中可见,Alexa Fluor 546共轭葡聚糖在红色通道中可见。测定并绘制每个细胞的每个通道中的平均强度。每个点代表一个单元格。显示了一个代表性实验,其中分别在A、B、C和D中分析了68、63、48和64个细胞。
图5。
图5。
添加hnRNP E1对体内翻译的影响。对照组B104细胞同时注射A2RE-GFP RNA和BSA(A)、GFP-A2RE RNA和hnRNP E1(B)、GFP-A8G RNA和BSA(C)以及GFP-A8G RNA和hnRNP-E1(D)。所有RNA均为聚腺苷酸,所有注射混合物均含有Alexa Fluor 546共轭右旋糖酐。新合成的GFP在绿色通道中可见,Alexa Fluor 546共轭葡聚糖在红色通道中可见。(D) 测定并绘制每个细胞的每个通道中的平均强度。每个点代表一个单元格。有代表性的实验显示有43、52、36和28个细胞,分别在A、B、C和D中进行分析。向B104细胞注射Cy-5标记的GFP-A2RE RNA(E,a和d)、Cy-5标签的GFP-A2 RE RNA和hnRNP E1(E,b和E)、Cy-5标记的GFP-A2RE和RNA酶a(E,c和f),并在注射后30分钟(E,a-c)和6小时(E,d-f)进行成像。计算细胞核和细胞质中平均荧光强度的比值(F)。在这两个时间点,单独注射RNA和带有hnRNP E1的RNA的细胞的核质比显著小于注射RNA和RNA酶的细胞。显著性评估为p<0.01。
图6。
图6。
hnRNP E1对体外翻译的影响。(A) 在没有或存在hnRNP E1(50、100、600或1200 nM)的情况下,GFP-A2RE RNA(150 ng)在RRL中翻译。(B) GFP-A2RE RNA(150 ng)在hnRNP A2(100 nM)存在和hnRNP E1(50、100、600或1200 nM)不存在或存在的情况下翻译。荧光素酶RNA(对照)(250 ng)和GFP-A2RE RNA(150 ng)在hnRNP A2(100 nM)存在和hnRNP E1(100、200、600或1200 nM)不存在的情况下一起翻译。(C) GFP-A8G RNA(150 ng)在hnRNP A2(100 nM)存在和hnRNP E1(50、100、600或1200 nM)不存在或存在的情况下翻译。(D) GFP和荧光素酶的合成量在免疫检测后进行量化,在不添加任何裂解物的情况下用RNA产生的量被设置为代表100%的翻译效率。条形图表示标准偏差。(E) 用兔抗hnRNP E1进行SDS-PAGE和Western blot检测。1号车道,RRL;车道2,rhnRNP E1;通道3,含有150 ng A2RE RNA的RRL抗hnRNP A2免疫沉淀物;通道4,含有150 ng A2RE RNA和重组hnRNP A2(rhnRNP A2)的RRL抗hnRNP A2-免疫沉淀(100 nM);通道5、含有150 ng A2RE RNA的RRL免疫沉淀、重组hnRNP A2(100 nM)和重组hnRNP-E1(1200 nM);和通道6,重组hnRNP A2(100 nM)和重组hnRNP-E1(1200 nM)在盐水中的抗-hnRNP A2免疫沉淀。

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