Effects of modified digestion schemes on the identification of proteins from complex mixtures

doi:10.1021/pr050315j

。2006年3月；5(3):695-700.

doi:10.1021/pr050315j。

改良消化方案对复杂混合物中蛋白质鉴定的影响

Aaron A Klammer先生¹, 迈克尔·麦克斯

附属公司

PMID： 16512685
预防性维修识别码：项目经理2535816
内政部： 10.1021/pr050315j

改良消化方案对复杂混合物中蛋白质鉴定的影响

Aaron A Klammer先生等。蛋白组学研究杂志。 2006年3月。

。2006年3月；5(3):695-700.

doi:10.1021/PR50315j。

作者

Aaron A Klammer先生¹, 迈克尔·麦克斯

附属

¹美国华盛顿州西雅图华盛顿大学基因组科学系，邮编98195。

PMID： 16512685
预防性维修识别码：项目经理2535816
内政部： 10.1021/pr050315j

摘要

在鸟枪蛋白质组学中，复杂的蛋白质混合物被消化成肽，分离，并通过微毛细管液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）进行鉴定。在这项技术中，通常假设蛋白质完全消化。相反，我们表明，对标准消化方案的修改证明了蛋白质鉴定方面的巨大、可重复的改进，这一结果与消化是蛋白质鉴定效率的限制因素相一致。

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数字

图1
经鉴定的胰蛋白酶肽对已鉴定蛋白质的序列覆盖率分布。通过质谱鉴定整个蛋白质序列中的肽是罕见的；通常只有一部分蛋白质的肽被回收。通过其识别的肽增加蛋白质的序列覆盖率，增加蛋白质识别的信心。

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[7] Fountoulakis M.化学技术和生物技术杂志。1995;第62:81–90页。

[8] Fountoulakis M.化学技术和生物技术杂志。1995;第62:81–90页。

[9] Hassett DJ、Alsabbagh E、Parvatiyar K、Howell ML、Wilmott RW、Ochsner UA.细菌学杂志。2000;182:4557–4563.-项目管理咨询公司-公共医学

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