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.2005年11月1日;21(21):4054-9.
doi:10.1093/bioinformatics/bti660。 Epub 2005年9月8日。

基于液相色谱-质谱的蛋白质组学数据预处理

附属公司

基于液相色谱-质谱的蛋白质组学数据预处理

张翔(音)等。 生物信息学. .

摘要

动机:在基于液相色谱-质谱(LC-MS)的表达蛋白质组学中,平行分析来自不同组的多个样品。有必要开发一个数据挖掘系统来执行峰值量化、峰值对齐和数据质量保证。

结果:我们开发了一种频谱反褶积算法。提出了一种两步对齐算法,用于识别由相同肽产生但在不同样本中检测到的峰。使用统计测试和比对质量测试评估LC-MS数据的质量。

可利用性:Xalign软件可根据作者的要求提供。

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