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.2005年7月;2(7):495-502.
doi:10.1038/nmeth768。

基于标签的转录组研究和基因组注释方法

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基于标签的转录组研究和基因组注释方法

马蒂亚斯·哈伯斯等人。 Nat方法. 2005年7月.

摘要

随着全基因组序列数量的增加,基因组研究已转向功能元件和转录区的注释。因此,转录组研究的相关领域需要准确的方法来分析基因,这些方法不受已知序列信息的影响,也允许识别启动子区域。从基因表达的序列分析(SAGE)开始,利用短序列标签的方法对转录组研究做出了巨大贡献。在这里,我们回顾了短序列标签在表达谱分析、基因发现和基因组注释中的应用进展。这些标签是从mRNA的5'端、mRNA的两端或基因组区域获得的。5'末端特异性标记具有识别转录物及其转录起始位点的能力,将对基因网络研究特别感兴趣,并可能成为系统生物学中最重要的方法之一。

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