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比较研究
.2005年7月;5(10):2602-11.
doi:10.1002/pmic.200401196。

大肠癌蛋白质组的双向差异凝胶电泳分析

附属公司
比较研究

大肠癌蛋白质组的双向差异凝胶电泳分析

帕特里夏·阿方索等人。 蛋白质组学. 2005年7月.

摘要

结直肠癌特异性蛋白标记物的鉴定将为早期诊断和检测提供依据,并为理解癌症进展的分子机制提供线索。在本报告中,我们描述了7名患者的结直肠癌样本的蛋白质组分析。我们使用高灵敏度二维差异凝胶电泳(2-D DIGE)结合质谱(MS)鉴定肿瘤和邻近正常粘膜中差异表达的蛋白质。我们检测到52种蛋白质的丰度差异,肿瘤与正常斑点体积比的统计方差在第95个置信水平内(Student t检验;p<0.05)。通过基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱结合数据库查询,在52个分析蛋白中有41个在结直肠癌中明确鉴定为差异表达。对这些蛋白的本体论分析表明,它们主要参与转录调控(滑膜肉瘤X5蛋白、转移相关蛋白1)、细胞重组和细胞骨架(细胞角蛋白、波形蛋白、β-肌动蛋白)、细胞通讯和信号转导(膜联蛋白IV和V、松弛素、APC),以及蛋白质合成和折叠(热休克蛋白60、钙网蛋白、组织蛋白酶D、RSP4)等。初步研究表明,在少数有抗体的病例中,2-D DIGE发现的差异表达蛋白可以通过免疫印迹和免疫组织化学分析进行确认和验证。我们相信,更多样本和新数据集的结合将允许定义一组具有潜在兴趣的蛋白质,作为结直肠癌的生物标记物。

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