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.2004年12月;60(第12部分第1部分):2210-21。
doi:10.1107/S090744490416427。 Epub 2004年11月26日。

BUSTER-TNT中具有极大似然的严重不完备结构的精化

附属公司

BUSTER-TNT中具有极大似然的严重不完备结构的精化

E布兰科等。 Acta Crystallogr D生物晶体仪. 2004年12月.

摘要

BUSTER-TNT是一种最大可能性的高分子精制包。BUSTER组装结构模型,缩放观测和计算的结构因子振幅,并计算模型可能性,而TNT处理立体化学和NCS约束/约束,并改变原子坐标、B因子和占用率。在实际空间中,除了传统的原子和大块固体模型外,BUSTER还将原子模型尚不可用的结构部分(“缺失结构”)建模为缺失原子随机位置的低分辨率概率分布。在互易空间中,复数平面中的BUSTER结构因子分布是一个二维高斯分布,以原子、体积-固体和缺失-结构模型计算的结构因子为中心。将与这三个结构分量相关的误差相加,以计算高斯波的总传播。当原子模型非常不完整时,缺失结构的建模和BUSTER统计模型的一致性有助于结构的构建和完成,因为(i)整体比例因子的准确性提高了,(ii)通过考虑缺失结构的一些散射,减少了影响原子模型精细化的偏差,(iii)在不完整源中添加空间定义改进了传统的基于Luzzati和sigmaA的误差模型,(iv)该程序可以单独在未建成结构区域进行选择性密度修改。

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