从串联质谱库中通过机器学习进行基于强度的蛋白质识别
摘要
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使用串联质谱进行大规模数据库搜索:在书的后面查找答案。 自然方法。 2004年12月; 1(3):195-202. doi:10.1038/nmeth725。 自然方法。 2004 PMID: 15789030 审查。 -
通过质谱盲搜索识别翻译后修饰。 国家生物技术。 2005年12月; 23(12):1562-7. doi:10.1038/nbt1168。 Epub 2005年11月27日。 国家生物技术。 2005 PMID: 16311586 -
差异蛋白质组学的半监督LC/MS比对。 生物信息学。 2006年7月15日; 22(14):e132-40。 doi:10.1093/bioinformatics/btl219。 生物信息学。 2006 PMID: 16873463 -
基于概率的模式识别和随机化统计框架:串联质谱/肽序列假匹配频率建模。 生物信息学。 2007年9月1日; 23(17):2210-7. doi:10.1093/bioinformatics/btm267。 Epub 2007年5月17日。 生物信息学。 2007 PMID: 17510167 -
通过质谱和经典蛋白质化学方法进行磷蛋白组学。 2005年11月至12月的质谱修订版; 24(6):828-46. doi:10.1002/mas.20042。 2005年版质谱。 PMID: 15538747 审查。
引用人
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保留时间和片段化预测因子增加了识别常见变异肽的信心。 蛋白质组研究杂志2023年10月6日; 22(10):3190-3199. doi:10.1021/acs.jproteome.3c00243。 Epub 2023年9月1日。 蛋白质组研究杂志2023。 PMID: 37656829 免费PMC文章。 -
MSBooster:使用基于深度学习的特征提高肽识别率。 国家公社。 2023年7月27日; 14(1):4539。 doi:10.1038/s41467-023-40129-9。 国家公社。 2023 PMID: 37500632 免费PMC文章。 -
使用质谱法进行物质鉴定的专家算法:单分子反应速率理论的统计基础。 美国社会科学杂志质谱。 2023年7月5日; 34(7):1248-1262. doi:10.1021/jasms.3c00089。 Epub 2023年5月31日。 美国社会科学杂志质谱。 2023 PMID: 37255332 免费PMC文章。 -
AIomics:使用人工智能扩展的质谱库探索更多蛋白质组。 蛋白质组研究杂志,2023年7月7日; 22(7):2246-2255. doi:10.1021/acs.jproteome.2c00807。 Epub 2023年5月26日。 蛋白质组研究杂志2023。 PMID: 37232537 -
基于机器学习的人工数据使用的关键评估 从头开始 肽鉴定。 《计算结构生物技术杂志》2023年4月17日; 21:2732-2743. doi:10.1016/j.csbj.2023.04.014。 eCollection 2023年。 计算结构生物技术杂志2023。 PMID: 37168871 免费PMC文章。