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.2003年12月;23(23):8820-8.
doi:10.1128/MCB.23.23.8820-8828.2003。

酵母Mre11和Rad1蛋白定义了Ku依赖性机制,以修复缺乏重叠末端序列的双链断裂

附属公司

酵母Mre11和Rad1蛋白定义了Ku依赖性机制,以修复缺乏重叠末端序列的双链断裂

贾林马等。 摩尔细胞生物学. 2003年12月.

摘要

双链断裂(DSB)的末端连接需要Ku蛋白,并且经常涉及互补末端序列之间的碱基配对。为了确定末端碱基配对在末端连接中的作用,将两个相向相反的HO内切酶切割位点整合到酵母染色体III中,其中HO内切酶的组成性表达创建了两个同时存在的没有互补末端序列的DSB。它们的3'单股悬垂部分缺乏互补序列,这有助于有效的修复事件,这与3'端具有以各种方式配对的4-bp序列基以创建2-3bp插入的情况截然不同。非补体末端的修复导致一组高达302 bp的非随机缺失,通过接合处约8-10 bp的不完全微同源性进行退火。这种微同源介导的末端连接(MMEJ)是Ku独立的,但强烈依赖于Mre11、Rad50和Rad1蛋白,部分依赖于Dnl4蛋白。当Rad52缺失时,MMEJ也会发生,但缺失的程度变得更加有限。与rad52Delta yku70Delta菌株相比,rad1Delta rad52Delta yku70Delta菌株的伽马射线敏感性增加,这表明MMEJ也有助于修复电离辐射诱导的DSBs。

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图1。
图1。
HO裂解位点材料SLY18和SLY19中第三染色体的位点。HO内切酶诱导后,SLY18产生两个互补性断裂,而SLY19则形成非互补性断裂。用于PCR扩增和幸存者修复连接序列分析的引物的位置如箭头所示。
图2。
图2。
影响的实证分析雷达1,RAD52型、和YKU70型γ射线超敏反应。采集酵母细胞的对数培养物,并将其重新悬浮在磷酸盐缓冲盐水中,将其置于YEP-葡萄糖培养基上,并用指示剂量的γ射线照射。在生长3至4天后,对存活的菌落进行计数,并通过与模拟处理细胞的菌落数量进行比较来计算存活率。存活率无线电频率+(实心圆),放射性1Δ(开口钻石),yku70型Δ(实心钻石),雷达52Δ(方形开口),雷达52Δyku70型Δ(实心三角形),放射性1Δ雷达52Δ(开环),放射性14Δ雷达52Δyku70型Δ(开放三角形),以及雷达1Δ雷达52Δyku70型Δ(实心正方形)单元格如图所示。每个实验点代表三个独立实验的平均值。
图3。
图3。
MMEJ模型。所示为SLY19中最频繁的加入活动。假设由两个HO内切酶识别序列的裂解所产生的4-bp 3′非互补悬垂的末端处理将揭示调节退火的微同源性。随后主要依赖于Rad1-Rad10的3′-皮瓣切除将启动Dnl4的填充合成和连接。微同源性以粗体显示。未配对的3′襟翼显示为小写字母。箭头右侧列出了每个步骤中可能起作用的基因产物。

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引用人

工具书类

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