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.2003年7月;49(2):277-300.
doi:10.1046/j.1365-2958.2003.03580.x。

先知和细菌基因组学:到目前为止我们学到了什么?

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先知和细菌基因组学:到目前为止我们学到了什么?

谢伍德·卡斯延斯(Sherwood Casjens). 摩尔微生物. 2003年7月.
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摘要

细菌基因组核苷酸序列正在以快速且不断增加的速度完成。整合病毒基因组(原噬菌体)在这类基因组中很常见。迄今为止公布的82个此类基因组中,有51个携带原噬菌体,其中包含230个可识别的假定原噬菌物。前噬菌体可能占细菌基因组的10-20%,是物种内个体差异的主要贡献者。这些前噬菌体中的许多似乎有缺陷,并处于突变衰变状态。前噬菌体,包括缺陷前噬菌器,可以为其细菌宿主提供重要的生物学特性。因此,如果我们要全面了解细菌基因组,我们必须能够通过核苷酸序列分析准确地识别和理解其前噬菌体。分析前噬菌体的进化可以阐明噬菌体及其宿主的进化。比较三株大肠杆菌序列基因组中的Rac原噬菌体和两株脑膜炎奈瑟菌菌株中的Pnm-前噬菌体表明,一些前噬菌物可以长期驻留,可能长达数百万年,重组事件发生在细菌基因组中不同位置的相关原噬菌体之间。此外,缺陷原噬菌体中的许多基因仍然具有功能,因此温带噬菌体基因库的很大一部分位于原噬菌器中。

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