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.2002年10月15日;74(20):5383-92.
doi:10.1021/ac025747h。

估算MS/MS和数据库搜索肽鉴定准确性的经验统计模型

附属公司

估算MS/MS和数据库搜索肽鉴定准确性的经验统计模型

安德鲁·凯勒等。 Ana Chem公司. .

摘要

我们提出了一个统计模型来评估由数据库搜索应用程序(如SEQUEST)对串联质谱(MS/MS)进行肽分配的准确性。利用期望最大化算法,分析学习区分正确和错误的数据库搜索结果,根据数据库搜索得分和肽的胰蛋白酶末端数量计算肽分配到光谱正确的概率。使用SEQUEST搜索结果对已知蛋白质组分样本产生的光谱进行搜索,我们证明计算出的概率是准确的,并且能够区分正确分配的肽和错误分配的肽。通过这种分析,可以过滤大量具有可预测错误识别率的MS/MS数据库搜索结果,并可以作为比较不同研究组结果的通用标准。

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