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.2002年11月；71(5):1161-7.
doi:10.1086/344395。 Epub 2002年8月29日。

肾病和色素性视网膜炎中一个突变的基因编码一种在进化中保守的新蛋白，即肾视网膜素

埃德加·奥托 1, 朱莉娅·霍费尔, Rainer Ruf公司, 阿德海德·穆勒, 卡尔·S·希勒, 马蒂亚斯·T·F·沃尔夫, 玛丽亚·舒尔曼, 阿奇姆·贝克尔, 拉尔夫·比肯赫, 拉尔夫·萨德布拉克, 汉斯·汉妮斯, 彼得·纽恩伯格, 弗里德海姆·希尔德布兰特
附属公司

肾病和色素性视网膜炎中一个突变的基因编码一种在进化中保守的新蛋白，即肾视网膜素

埃德加·奥托等。 美国人类遗传学杂志. 2002年11月.

摘要

肾病（NPHP）由一组常染色体隐性遗传囊性肾病组成，是儿童和年轻人终末期肾衰竭最常见的遗传原因。NPHP最显著的组织学特征包括肾纤维化的发展，在任何来源的慢性肾衰竭中，肾纤维化代表与肾功能丧失最密切相关的致病事件。已将四个NPHP基因座定位到染色体2q13（NPHP1）、9q22（NPHP2）、3q22（NFPP3）和1p36（NPHP4）。在所有四个基因座上，NPHP与视网膜色素变性（称为“老年Löken综合征”，SLS）相关的家族中也证明了这种联系。对NPHP 1型基因的鉴定揭示了肾胱氨酸是一种新的对接蛋白，为细胞-细胞和细胞-基质信号机制提供了新的见解。我们在这里报告了通过使用高分辨率单倍型分析和在六个受影响的家庭中证明九个可能的功能丧失突变，鉴定导致NPHP 4型的基因（NPHP4）。NPHP4编码一种新的蛋白质，即肾视网膜蛋白，在进化过程中是保守的，例如在秀丽隐杆线虫中。此外，我们在两个SLS家族的患者中证明了NPHP4的两个功能丧失突变。因此，我们确定了一个在肾组织结构和眼功能中具有关键作用的新基因。

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数字

图1
图1
染色体1p36上的单倍型结果用于NPHP4核电站三个NPHP近亲家庭受影响后代的基因座。家族、世代和个体数在单倍型以上。父亲单倍型显示在蓝色背景上，母亲单倍型则显示在黄色背景上。在这个家系的亲子传播中直接观察到的母体单倍型中的重组显示在橙色背景上。在左侧，8个已发布的微卫星以斜体显示，38个新生成的微卫星则以罗马文显示。已发表的2.1-Mb临界值的侧面标记NPHP4核电站区间用红色表示。信息性等位基因用下划线表示。连续纯合子的单倍型被包装在盒子里。纯合子作图显示标记D1E23的p末端重组(星号)基于个体F30 II-2和F30 II-3的杂合性以及标记SNP-KIAA0720-Ex19的观察重组(星号)在个体F30 II-3中，从而将关键遗传区域细化到安全区间<1.2 Mb。根据F30单独产生的显著LOD分数（Schuermann等人，2002年），这种改进产生了安全边界。通过标记D1E19和D1S2870型(双星号)分别为F32 II-1和F60 II-1。这将关键遗传区域细化到提示间隔<700 kb。由于每个家庭中只有两个受影响的个体，这种细化只是暗示。p-ter=端粒；cen=着丝粒；nd=未完成。
图2
图2
位置克隆策略NPHP4核电站基因，位于人类染色体1p36上。A、，微卫星的遗传图位置用于NPHP4核电站（见图1）。使用马什菲尔德地图的性别平均遗传距离（cM）。已发布的侧翼标记带有下划线（Schuermann等人，2002年）。p-ter=端粒；cen=着丝粒。B、，关键微型卫星相对于D1S2660。安全的1.2兆临界区间(实心钢筋)以及700-kb的暗示临界区间(点画条)由新确定的安全侧翼标记分隔(星号)和提示性侧翼标记(双星号)由单倍型分析定义（见图1）。轴下方是已知基因(绿色)，预测未知基因(蓝色)、和NPHP4核电站基因（也称为“问题9UFQ2“）表示为转录方向的箭头。C、，基因组组织NPHP4，外显子由垂直阴影表示并编号。D、，外显子结构NPHP4核电站cDNA。黑色和非黑色方框代表编码肾视网膜素的30个外显子。指出了每个外显子的第一个密码子的数目；以密码子第二或第三碱基开头的外显子分别用“b”或“c”表示。在底部，在8个具有NPHP4核电站显示了突变。fs=帧移位。E、 NPHP4核电站五个近亲家庭受影响个体的纯合突变(下划线的). 未显示复合杂合突变。突变的核苷酸和改变的氨基酸显示在灰色背景上。
图3
图3
Northern杂交分析NPHP4核电站表达模式。人成体poly（A）的多组织northern印迹+RNA与584-bp杂交NPHP4核电站人类DNA探针。5.0-kb转录本的表达(箭头)在所研究的所有组织中都明显存在，骨骼肌中表达最高。
图A
图A
人类NPHP4核电站cDNA序列和推导的肾视网膜蛋白氨基酸序列。外显子在右边编号。外显子序列在颜色上交替。起始密码子、终止密码子和变异的多聚腺苷酸化信号AACAAA下划线。
图A
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人类NPHP4核电站cDNA序列和推导的肾视网膜蛋白氨基酸序列。外显子在右边编号。外显子序列在颜色上交替。起始密码子、终止密码子和变异的多聚腺苷酸化信号AACAAA下划线。
图A
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人类NPHP4核电站cDNA序列和推导的肾视网膜蛋白氨基酸序列。外显子在右边编号。外显子序列在颜色上交替。起始密码子、终止密码子和变异的多聚腺苷酸化信号AACAAA下划线。
图A
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人类NPHP4核电站cDNA序列和推导的肾视网膜蛋白氨基酸序列。外显子在右边编号。外显子序列在颜色上交替。起始密码子、终止密码子和变异的多聚腺苷酸化信号AACAAA下划线。
图A
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人类NPHP4核电站cDNA序列和推导的肾视网膜蛋白氨基酸序列。外显子在右边编号。外显子序列在颜色上交替。起始密码子、终止密码子和变异的多聚腺苷酸化信号AACAAA下划线。
图B
图B
人、鼠和秀丽线虫推导肾视网膜蛋白序列。从上到下的顺序是人、鼠和秀丽线虫（GenBank登录号分别为BankIt 486643、BankIt 4806675和Z81579）。相同之处以相反的方式显示（白底黑底），所有三个序列之间的相似之处以灰色背景显示。人和小鼠序列之间有82%的氨基酸同源性，人和小鼠之间有23%的氨基酸相似性秀丽线虫序列。序列上方的方框界定了括号中给出的程序预测的基序：NLS=核定位域（ACEVIEW）；ER=内质网膜域（ACEVIEW）；E-rich=谷氨酸-富结构域（SMART）；S-rich=富含丝氨酸的域（SMART）；富P=富含脯氨酸的结构域（MOTIF SCAN）；和DUF339=PFAM(第页蛋白质（f）家庭数据库一对齐米ents）未知函数域（MOTIF扫描）。在盐生H，BLAST程序检测到与以下蛋白的囊泡蛋白gvpL有30%的序列一致性盐藻（GenBank登录号P33964）。
图B
图B
人、鼠和秀丽线虫推导肾视网膜蛋白序列。从上到下的顺序是人、鼠和秀丽线虫（GenBank登录号分别为BankIt 486643、BankIt 4806675和Z81579）。同一性以相反的方式显示（白对黑），所有三个序列之间的相似性以灰色背景显示。人和小鼠序列之间有82%的氨基酸同源性，人和小鼠之间有23%的氨基酸相似性秀丽线虫序列。序列上方的方框界定了括号中给出的程序预测的基序：NLS=核定位域（ACEVIEW）；ER=内质网膜域（ACEVIEW）；E-rich=谷氨酸-富结构域（SMART）；S-rich=富含丝氨酸的域（SMART）；富P=富含脯氨酸的结构域（MOTIF SCAN）；和DUF339=PFAM(第页蛋白质（f）家庭数据库一对齐米ents）未知函数域（MOTIF扫描）。在盐生H，BLAST程序检测到与以下蛋白的囊泡蛋白gvpL有30%的序列一致性盐藻H.salinarium（GenBank登录号P33964）。
图B
图B
人、鼠和秀丽线虫推导肾视网膜蛋白序列。从上到下的顺序是人、鼠和秀丽线虫（GenBank登录号分别为BankIt 486643、BankIt 4806675和Z81579）。相同之处以相反的方式显示（白底黑底），所有三个序列之间的相似之处以灰色背景显示。人和小鼠序列之间有82%的氨基酸同源性，人和小鼠之间有23%的氨基酸相似性秀丽线虫序列。序列上方的方框按照括号中给出的程序的预测来划分基序：NLS=核定位域（ACEVIEW）；ER=内质网膜域（ACEVIEW）；E-rich=谷氨酸-富结构域（SMART）；S-rich=富含丝氨酸的域（SMART）；富P=富含脯氨酸的结构域（MOTIF SCAN）；和DUF339=PFAM(第页蛋白质（f）家庭数据库一对齐米ents）未知函数域（MOTIF扫描）。在H.盐藻，BLAST程序检测到与以下蛋白的囊泡蛋白gvpL有30%的序列一致性盐藻H.salinarium（GenBank登录号P33964）。
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    1. AceView、，http://www.ncbi.nlm.nih.gov/IEB/Research/Acembly网站/（用于基因组结构）
    1. 集成基因组浏览器，http://www.ensembl.org（英语）/（用于NPHP4的基因组结构）
    1. ExPASy分子生物学服务器，网址：http://www.expasy.ch/（用于Tmpred）
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    1. 马什菲尔德医学研究基金会主页，http://research.marshfieldclinic.org/（用于微卫星标记地图）

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    1. Antiginac C、Arduy C、Beckmann JS、Benessy F、Gros F、Medhioub M、Hildebrandt F、Dufier JL、Kleinknecht C、Broyer M（1993）家族性青少年肾结核（隐性髓质囊性疾病）的基因映射到染色体2p。《自然遗传学》3:342–345-公共医学
    1. Benzing T、Gerke P、Hildebrandt F、Kim E、Walz G（2001）肾胱氨酸与Pyk2、p130cas和张力蛋白形成多聚蛋白复合物，并触发Pyk1的磷酸化和活化。美国国家科学院院刊98:9784–9789-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Burset M，Seledtsov IA，Solovyev VV（2001）标准和非标准哺乳动物剪接位点的SpliceDB数据库。核酸研究29:255–259-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Caridi G、Murer L、Bellantuono R、Sorino P、Caringella DA、Gusmano R、Ghiggeri GM（1998）《肾-视网膜综合征：NPH1基因纯合缺失患者视网膜异常与隐性肾病的相关性》。美国肾脏病杂志32:1059–1062-公共医学
    1. Dib C、Faure S、Fizames C、Samson D、Drouot N、Vignal A、Millasseau P、Hazan J、Seboun E、Lathrop M、Gyapay G、Morissette J、Weissenbach，J（1996）基于5264颗微卫星的人类基因组综合遗传图谱。自然380:152–154-公共医学

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