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.1999年5月;6(5):458-63.
doi:10.1038/8263。

结合迭代结构精化的自动化蛋白质模型构建

附属公司

结合迭代结构精化的自动蛋白质模型构建

佩拉基斯等。 自然结构生物. 1999年5月.

摘要

在蛋白质晶体学中,从可解释的电子密度图中追踪初始模型,并对其进行细化,直到其与晶体学数据最为一致,通常需要花费大量时间和精力。在这里,我们提出了一种自动构建和完善蛋白质模型的方法,无需用户干预,从衍射数据扩展到高于2.3A的分辨率,以及对结晶相的合理估计开始。该方法基于一个迭代过程,将电子密度图描述为一组未连接的原子,然后搜索类蛋白质模式。自动模式识别(模型构建)与细化相结合,可以在几个CPU小时内可靠地获得结构模型。我们通过几个最近解决的结构示例来证明该方法的威力。

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