原核生物基因组注释管道使用的NCBI隐马尔可夫模型(HMM)8.0版(PGAP公司),现在可用于下载。您可以使用HMMER公司序列分析包。
8.0版本包含15358个型号,其中包括自7.0以来的160个新型号。此外,我们还添加了更好的名称、EC编号、,基因本体论(GO)超过550个现有HMM的术语、基因符号或出版物。您可以在蛋白质家族模型集合它还包括保守的域结构和BlastRules,并找到所有它们命名的RefSeq蛋白。
与HMM相关的GO术语现在传播到用PGAP注释的编码序列和蛋白质。如果您错过了,请参阅我们的上一篇博客文章关于这个话题。