标签：基因

增加约200万昆虫基因的同源群

增加约200万昆虫基因的同源群

F类ind进化rily相关基因跨越昆虫和其他 节肢动物在我们的新Ortholog网页

NCBI最近发布了一组大约200万个昆虫基因的直向同源物。现在，您可以通过在中搜索物种和基因名称来查找和访问同源基因、转录本和蛋白质NCBI所有数据库，NCBI基因，或NCBI数据集.作为前面描述过，这些正交曲线基于与黑腹果蝇带注释的基因组。使用果蝇属直系生物的基因命名法应能为昆虫和其他节肢动物提供更丰富的基因符号。  继续阅读“增加约200万昆虫基因的同源群” →

同源基因现在重定向到NCBI数据集基因

同源基因现在重定向到NCBI数据集基因

查看和下载相关基因的新方法 

作为之前宣布的，HomoloGene现在自动重定向到NCBI数据集基因页面让您可以轻松访问最新序列和同源性数据。NCBI数据集基因表提供了到NCBI Orthologs的链接，其中包含扩展的基因和蛋白质信息以及到工具的链接。NCBI Orthologs包含越来越多的分类群的更多基因和序列。请参阅下面的示例。Legacy HomoloGene数据在FTP站点. 继续阅读“同源基因现在重定向到NCBI数据集基因” →

在研究项目中使用NCBI数据和工具

在研究项目中使用NCBI数据和工具

你是生物系的学生吗？NCBI提供了对各种资源和工具的免费访问帮助您查找和下载项目的数据。  

您如何以及为什么使用我们的资源？查看以下示例：

你的教授分配给你一个研究项目，研究家猫TP53基因的序列和结构(费利斯·卡图s） 。此外，你还被要求在猫科动物（猫科动物）的其他成员中找到有关该基因及其基因组区域的信息。  继续阅读“在您的研究项目中使用NCBI数据和工具” →

现在可用！比较NCBI RefSeq和UniProt数据集

现在可用！比较NCBI RefSeq和UniProt数据集

您是否需要根据NCBI参考序列和UniProt公司数据集，并且不确定哪些蛋白质具有可比性？多年来，NCBI基因通过从UniProt导入的数据，提供了有关RefSeq和UniProt访问之间关系的信息，但这两个数据集的巨大增长导致了数据中的巨大差距。我们开发了一种新的方法来比较这两个数据集，首先寻找100%相同的蛋白质，然后检查其余序列在相关分类群中的相似匹配。结果是绘制了涵盖生命树中超过1.7亿RefSeq蛋白的信息。 

您可以在个人网站上找到相关UniProt材料的链接NCBI基因记录。整个数据集都可以在我们的FTP站点.   继续阅读“现在可用！比较NCBI RefSeq和UniProt数据集” →

查看和下载相关基因的新方法

查看和下载相关基因的新方法

自2023年6月起，同源基因记录将重定向到数据集基因表

重要注意事项：从HomoloGene到NCBI数据集的重定向延迟到2024年初。

你是否使用同源基因查看和下载数据？您现在可以访问更新的同源性数据NCBI数据集通过数据集基因表连接到NCBI正交测井。直接从HomoloGene记录转到Datasets Gene Table，您可以访问最新的序列数据和元数据。NCBI数据集是一种新的资源，允许您轻松地跨NCBI数据库收集数据。

数据集基因表提供与NCBI Ortholog接口（图1）的连接，该接口提供以下数据： 

  • 矫形数据基于识别超过500种脊椎动物的直系物种的更新算法 
  • 类似基因数据基于跨越所有真核生物的蛋白质结构 

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在ASHG 2022与NCBI连接

在ASHG 2022与NCBI连接

10月25-29日在加利福尼亚州洛杉矶加入我们

我们期待着您亲自出席美国人类遗传学学会（ASHG）年会，2022年10月25日至29日，加利福尼亚州洛杉矶。

我们将举办各种讲座和海报，展示我们的临床和人类遗传资源以及基因组产品和工具。我们很高兴介绍NIH比较基因组资源（CGR)这是一个多年的国家医学图书馆（NLM）项目，旨在最大限度地发挥真核生物研究生物体及其基因组数据资源对生物医学研究的影响。我如果您有兴趣提供反馈，以帮助推动CGR向前发展， 考虑加入 我们的圆桌讨论。  

查看NCBI的活动和事件时间表：

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来自基因组资源联盟的新基因信息

NCBI基因现在有关于来自基因组资源联盟对于生物体，包括秀丽隐杆线虫，达尼奥·雷里奥，黑腹果蝇，智人，小家鼠，褐家鼠、和酿酒酵母.

图1。果蝇slmb基因完整报告的基因摘要部分显示了与基因组资源联盟相应记录的链接。

Gene Full Report页面的Summary部分有到基因组资源联盟的基因页面的链接（图1）。这些也位于与其他资源的链接部分。对于没有RefSeq摘要的基因，我们使用来自基因组资源联盟的文本基因描述。

这个Drosphila公司 slmb基因记录显示了基因组资源联盟提供的增强功能。上的gene_info.gz文件基因FTP该站点还在dbXrefs列中包含AllianceGenome引用。

新NCBI基因群比较扩展

NCBI基因已添加集成快速发布计算NCBI RefSeq和Ensembl之间的匹配注释。这导致在集合中总共有241个生物体包含了60多个附加组件。匹配基于转录和CDS比较，与NCBI RefSeq注释类似的注释的集合基因、转录和蛋白质标识符在NCBI gene和基因FTP位点。在图形视图和NCBI的基因组数据查看器为您提供注释比较方式的并排视图。看看蓝鲸E2F1系列例如。

图1。肌肉平衡翅目E2F转录因子1在基因组数据查看器

新的NCBI数据集主页和文档页面提供了更轻松的访问

NCBI数据集，下载基因组组装和注释数据的新服务(以前的数据集帖子)，重新设计和重组了网页，使您更容易找到和访问所需的服务和文档。

NCBI数据集具有全新主页（图1）突出显示通过我们的工具可用的数据类型。可用数据包括基因组组装，基因、和SARS-CoV-2基因组和蛋白质数据。您可以从新页面轻松访问这些内容，或使用我们的新功能了解更多信息文档页面.

图1。新数据集主页的功能，可快速访问帮助文档，包括快速启动和如何操作指南以及对基因组、基因和冠状病毒数据以及数据集和数据格式命令行工具的访问。 继续阅读“新的NCBI数据集主页和文档页面提供了更轻松的访问” →