标签：真核基因组注释

新的RefSeq注释现在可用！

新的RefSeq注释现在可用！

2月和3月NCBI真核基因组注释管道释放46个新注释英寸参考序列!

新建批注
  • 白纹伊蚊（亚洲虎蚊）
  • 卡罗莱纳Anolis carolinensis（绿色anole）
  • 亚长臂猿（蚊子）
  • 红藤巴氏杆菌（手杖）
  • 微小鲍氏体病（鸡冠果冻）
  • 家蚕
  • 金龟子（金龟子）
  • 粗枝假丝酵母（蛇）
  • Cavia porcellus（家养豚鼠）
  • 继续阅读“新的RefSeq注释现在可用！” →
现已上市：RefSeq Release 223

现已上市：RefSeq Release 223

查看RefSeq 223版，现已推出联机和来自FTP文件现场。您可以通过以下方式访问RefSeq数据NCBI数据集.

此版本中包括什么？

截至2024年3月4日，此完整版本包含基因组、转录和蛋白质数据，包括：

  • 425594654条记录
  • 316329937蛋白质
  • 60886133个RNA
  • 147591种生物的序列

继续阅读“现在可用：RefSeq Release 223” →

NCBI RefSeq真核基因组的基因本体（GO）术语

NCBI RefSeq真核基因组的基因本体（GO）术语

你对蛋白质编码基因的更多功能信息感兴趣吗？ 我们扩展了NCBI RefSeq真核生物基因组注释管道（EGAP）包括为大多数蛋白质编码基因计算的基因本体（GO）术语。我们正在使用最新版本的InterProScan公司，现在包括基于PANTHER参考树，在所有NCBI RefSeq真核生物基因组上。这意味着拥有全面的GO数据，其中包含推断的生物过程、分子功能和细胞成分术语，并与数百个分类群的高质量RefSeq注释相匹配，以帮助推动您的研究。数据可从中的单个记录中获得NCBI的基因资源,NCBI基因FTP或在我们的每个RefSeq基因组版本的社区标准.gaf格式文件中FTP文件网站.  继续阅读“NCBI重组真核基因组的基因本体论（GO）术语” →

RefSeq！中的新注释！

RefSeq！中的新注释！

在7月、8月和9月NCBI真核基因组注释管道释放56个新注释在参考序列!

新建批注
  • 灰棘蝗（蛾）
  • 鲁氏鲟（斯特莱特）
  • Ahaetulla prasina（蛇）
  • 密西西比短吻鳄
  • 尾状锥虫（鸟类）
  • nelsoni（鸟类）
  • 按蚊（蚊子）
  • 库斯塔尼按蚊
  • 齐曼按蚊
  • 狭小花生
  • 鲫鱼
  • 条纹中脊鲷（黑鲈鱼）
  • 佛罗里达山茱萸（开花山茱萸）（如图所示）
  • 榛子（欧洲榛子）
  • 肠珊瑚（胡椒鱼）继续阅读“RefSeq中的新注释！” →
RefSeq！中的新注释！

RefSeq！中的新注释！

四月、五月和六月NCBI真核基因组注释管道释放八十二个新注释在参考序列!

集锦:

  • 智人（人类）T2T-CHM13v2.0现在包括了更多的可选剪接变体
  • 智人（人类）GRCh38.p14型包括来自鬃毛v1.2版本，包括78000多个新版本重新排序功能元素自2022年上次注释以来添加的（RefSeqFE）功能
  • 小家鼠GRCm39型自2020年9月以来，整合了3000多个基因和14000个转录本的管理
  • 褐家鼠（挪威鼠）额定BN7.2包括自2021年我们上次注释以来管理了5000多个基因

新批注:继续阅读“RefSeq中的新注释！” →

利用NIH比较基因组资源（CGR）革新您的研究

利用NIH比较基因组资源（CGR）革新您的研究

与美国国立卫生研究院（NIH）一起充分挖掘真核生物研究有机体及其基因组数据的潜力比较基因组学资源.CGR通过社区协作以及由互联、互操作数据和工具组成的NCBI工具包，促进了可靠的比较基因组学分析。  

比较基因组学是一个研究领域，它使用许多不同生物体的基因组来帮助我们了解基本的生物过程和人类疾病。NCBI正在开发CGR，以帮助研究人员充分利用快速增长的真核生物数量，由于最近的技术进步，这些真核生物现已测序基因组和相关数据，可用于这些类型的研究。其NCBI工具包为此类分析提供了新的现代资源，其对社区协作的强调为共享和连接数据带来了新的机会。   继续阅读“利用NIH比较基因组资源（CGR）革新您的研究” →

RefSeq！中的新注释！

RefSeq！中的新注释！

2月和3月NCBI真核基因组注释管道在中发布了42个新注释参考序列针对以下列出的生物体。此外，在这段时间内，为60多个物种进行了临时构建，以解决基因符号分配的一些问题。