标签：比较基因组学资源

RefSeq Release 226可用！

RefSeq Release 226可用！

查看RefSeq 226版，现已推出联机和来自文件传输协议现场。您可以通过以下方式访问RefSeq数据NCBI数据集。该版本作为一个完整的数据集在多个目录中提供，并按逻辑分组进行划分。

此版本中包括什么？

截至2024年9月13日，此完整版本包含基因组、转录物和蛋白质数据，包括：

  • 472512852条记录
  • 355355673种蛋白质
  • 65576846个RNA
  • 155792种生物的序列

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NCBI首次生物教育峰会取得了成功！

NCBI首次生物教育峰会取得成功！

NCBI首次举办生物教育峰会：利用NCBI资源打造以学生为中心的课程这项为期一周的活动于2024年8月5日至9日在马里兰州贝塞斯达的国立卫生研究院（NIH）校园举行，面向美国各地的科学教育工作者。 

事件详细信息 

在这一周中，教育工作者参加了上午的会议，包括关于NCBI教育课程设计的互动研讨会，各种NCBI资源在教学中的使用，以及使用NCBI工具的详细实践讨论和实践。与来自多个机构的领导就在科学课堂上使用新颖、数据驱动的主动学习练习进行小组讨论，包括：  继续阅读“NCBI首次生物教育峰会取得了成功！” →

使用NCBI数据集访问和下载序列数据和元数据

使用NCBI数据集访问和下载序列数据和元数据

再见组装和基因组，你好NCBI数据集！

令人兴奋的消息！NCBI简化并现代化了您访问和下载基因组、分类法和基因信息的方式NCBI数据集.作为之前宣布的，NCBI数据集正在取代传统的基因组和汇编资源，为您提供基因组数据集的单一入口点。从今天起，旧页面已退役，不再可用。

请注意，使用电子实用程序或E直接.继续阅读“使用NCBI数据集访问和下载序列数据和元数据” →

使用NCBI的新BLAST核心核苷酸数据库（Core_t）获得更快、更集中的搜索结果

使用NCBI的新BLAST核心核苷酸数据库（Core_t）获得更快、更集中的搜索结果

自2024年8月起，core_t将成为默认值 

对更快的核苷酸感兴趣爆炸搜索结果更加集中？作为之前宣布的NCBI一直在重新评估BLAST核苷酸数据库（nt），以使其更紧凑、更高效。感谢您的反馈，NCBI的BLAST很高兴引入核心核苷酸数据库（core_t），它是默认nt数据库的替代品，包含更好定义的内容，并且大小不足其一半。 

BLAST core_t优于nt的优点
  • 支持更快的搜索
  • 返回大多数搜索的类似顶级结果
  • 减少一些高度代表性生物体的冗余
  • 允许更轻松地下载，对于独立BLAST，数据库下载所需的存储空间更少

继续阅读“使用NCBI的新BLAST核心核苷酸数据库（Core_t）获得更快、更集中的搜索结果” →

RefSeq 225版现已推出！

RefSeq 225版现已推出！

查看RefSeq 225版，现已推出联机和来自文件传输协议现场。您可以通过以下方式访问RefSeq数据NCBI数据集.

此版本中包括什么？

截至2024年7月8日，此完整版本包含基因组、转录和蛋白质数据，包括：

  • 448507905条记录
  • 334845613蛋白质
  • 63542774个RNA
  • 152668种生物的序列

该版本作为完整的数据集在多个目录中提供，也按逻辑分组进行划分。继续阅读“RefSeq 225版现已推出！” →

增加约200万昆虫基因的同源群

增加约200万昆虫基因的同源群

F类ind进化rily相关基因跨越昆虫和其他 节肢动物在我们的新Ortholog网页

NCBI最近发布了一组约200万个昆虫基因的同源基因。现在，您可以通过在中搜索物种和基因名称来查找和访问直向同源基因、转录本和蛋白质NCBI所有数据库,NCBI基因，或NCBI数据集.作为前面描述过，这些正交曲线基于与黑腹果蝇带注释的基因组。使用果蝇属直系生物的基因命名法应能为昆虫和其他节肢动物提供更丰富的基因符号。  继续阅读“增加约200万昆虫基因的同源群” →

新增！RefSeq版本224

新增！RefSeq版本224

查看RefSeq 224版，现已推出联机和来自文件传输协议现场。您可以通过访问RefSeq数据NCBI数据集.

此版本中包括什么？

截至2024年5月6日，此完整版本包含基因组、转录和蛋白质数据，包括：

  • 435879646条记录
  • 324246652蛋白质
  • 62348147个RNA
  • 150742种生物的序列

该版本作为完整的数据集在多个目录中提供，也按逻辑分组进行划分。继续阅读“新建！RefSeq版本224” →

清理BLAST数据库以获得更准确的结果

清理BLAST数据库以获得更准确的结果

使用NCBI质量保证工具移除受污染序列 

你是否使用爆炸确定基因的序列或进化范围？如果BLAST数据库中存在受污染和错误分类的序列并显示在搜索结果中，那么这可能是一个挑战。收件人地址这个问题，我们现在使用下面列出的NCBI质量保证工具从默认核苷酸（nt）和蛋白质（nr）BLAST数据库中系统地删除这些误导性序列。  继续阅读“清理BLAST数据库以获得更准确的结果” →

保留域数据库3.21版现已推出！

保留域数据库3.21版现已推出！

查看最新发布的保守结构域数据库（CDD）版本3.21。更新的内容可在CDD FTP站点.

有什么新功能？

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使用NCBI数据集浏览分类记录

使用NCBI数据集浏览分类记录

新的和改进的NCBI数据集分类页面和命令行服务 

NCBI数据集很高兴为我们的分类页面使您更容易访问、浏览和下载任何分类级别的生物体分类信息。  

有什么新鲜事吗？
  • 通过更新的外观探索分类法记录
  • 从web或通过我们的更新访问和下载分类元数据命令行（CLI）工具 

继续阅读“使用NCBI数据集浏览分类记录” →