具有新数据库和更好性能的BLAST+2.8.1

BLAST+2.8.1现在可获得的从我们的FTP站点下载。这是第一个独立BLAST的生产版本,用于支持新的BLAST v5数据库(BLASTDBv5),现在可获得的。新数据库具有内置数据库序列的分类信息。与v4数据库相比,这为您提供了以下重要优势。

  1. 通过分类群-物种级别以及更高分类群来限制搜索的能力。
  2. 改进了使用访问限制BLAST搜索时的性能。
  3. 利用blastdbcmd从BLAST数据库中按分类组检索序列。

搜索程序选项还有一些其他增强功能。

  1. 一个新选项(-subject_besthit)通过删除被另一个HSP完全包围的HSP,以每个受试者序列为基础剔除HSP。这是一个实验性选项,可能会发生变化。
  2. 现在允许对格式0-4使用-max_target_seqs选项。对齐和描述的数量将设置为max_target_seqs。
  3. 如果-max_target_seqs设置为小于5,BLAST现在会发出警告,指出可能无法看到所有等效匹配。

新版本还包括一些错误修复。请参阅发行说明如需更多详细信息,请随时写信给我们blast-help@ncbi.nlm.nih.gov有任何问题。

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