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提交作者:@兹夫兰切(亚历山大·勒奈尔) 存储库: https://github.com/zfrenchee/NN-SVG 版本:1.0.0 编辑: @阿丰 审核人: @尼罗河流域,@特里汤元 档案文件: 10.5281/zenodo.2541121
状态徽章代码:
HTML:<a href=“http://joss.theoj.org/papers/52b511ab107595a805107aa4ad70161d“><img src=”http://joss.theoj.org/papers/52b511ab107595a805107aa4ad70161d/status.svg“>”</a>降价:[![状态](http://joss.theoj.org/papers/52b511ab107595a805107aa4ad70161d/status.svg)](http://joss.theoj.org/papers/52b511ab107595a805107aa4ad70161d)
审查人和作者:
请避免在审查线索中详细说明困难。相反,请在目标存储库并在下面的评论线程中链接到这些问题(尤其是接受障碍)。(对于完美主义者:如果目标问题跟踪器也在GitHub上,则链接问题中的审阅线程或反之亦然,将在链接目标中创建相应的面包屑轨迹。)
@尼罗河流域&@特里汤元,请通过更新下面的检查表来进行此问题的审查。如果您无法编辑检查表,请:
审阅者指南可在此处获得:https://joss.theoj.org/about#reviewer_guidelines.如有任何问题/疑虑,请告知@阿丰知道了。
纸张.md
文本已成功更新,但遇到以下错误:
你好,人类,我是@小麦。我来这里是为了帮助你完成一些常见的编辑任务。@尼罗河流域,看起来你目前被指派为这篇论文的审稿人🎉.
⭐ 重要⭐
如果您还没有,您应该认真考虑取消订阅GitHub通知(https://github.com/openjournals/joss-reviews网站)存储库。作为审阅者,您可能正在监视此存储库,这意味着对于GitHub的默认行为,您将收到所有审阅的通知(电子邮件)😿
要解决此问题,请执行以下两件事:
要获得我可以帮助您的列表,只需键入:
@whedon命令
对不起,出了点问题。
正在尝试PDF编译。网状花键等。。。
-->检查物品证明📄 <--
@尼罗河流域,@特里汤元-请通过更新上述检查表并在本期中提供反馈来进行本期审查。审阅者指南可在此处获得:http://joss.theoj.org/about评审指南
如有任何问题/疑虑,请告诉我。
您好!@尼罗河流域,@特里汤元,感谢您同意对此进行审查!我现在要进行第一轮编辑,以符合我在上面看到的检查表——我可以看出已经缺少了一些东西。大约一个小时后,你们就可以复习了。
哦,还有关于这个项目的一个重要注意事项,@阿丰,@尼罗河流域,@特里汤元,NN-SVG主要是一个网络工具,而不是一个包。尽管此项目是在考虑可扩展性的情况下构建的(我已经被联系过在其他地方使用它)本规范的主要目的是作为现场。因此,没有安装说明/API方法等。。。
所以我会在这些复选标记旁边加上N/a。
因此,没有安装说明/API方法等。。。
只是稍微推开这个@zfrenchee。虽然我知道这可能不是用一个干净的API包装在一个库/模块中,但我认为应该提供此软件的安装说明(即如何亲自运行此站点)。
@阿丰这是一个有趣的想法。再说一遍,它们只是HTML页面,所以我想不出太多要解释的东西。但我会继续考虑。。
我已经完成了第一轮复习。几条反馈:
@特里汤元 @阿丰感谢您的反馈,很抱歉延迟了回复。经过仔细思考,我发现你说得很对,如果我把它变成一段可以更广泛使用的独立代码,这个工具将更广泛地适用。不幸的是,这将需要相当多的重构和重新架构,而在不久的将来我可能没有时间去做这些。如果你同意的话,我就把这个问题留着,希望能在接下来的1-3周内解决。听起来不错吗?
感谢您的反馈,很抱歉延迟了回复。经过仔细思考,我发现你说得很对,如果我把它变成一段可以更广泛使用的独立代码,这个工具将更广泛地适用。不幸的是,这需要进行一些重构和重新架构,我可能在不久的将来没有时间去做这些。如果你同意的话,我就把这个问题留着,希望能在接下来的1-3周内解决。听起来不错吗?
是的,这完全可以。我会把这个标记为暂停现在-请让我知道,当你准备再次拿起这个线程。
暂停
@阿丰 @特里汤元我已经完成了重构。我相信现在可以在其他网站上使用这个工具了。我可能仍然应该添加有关如何做到这一点的文档。除此之外,还需要做什么?前进的道路是什么?我应该添加文档,然后再进行一轮审查吗?
@阿丰 @特里汤元我写了一些文档:https://github.com/zfrenchee/NN-SVG/wiki/NN-SVG-API我相信稍微更新一下这篇论文是有意义的,但我也认为我已经做好了下一轮复习的准备,除非我忘记了什么?
@阿丰你能把“暂停”的标签去掉吗?
@尼罗河流域 @特里汤元-请过来再看看这个。
@尼罗河流域-你认为你能很快地进行复习吗?🙏
仍然希望看到此评论@阿丰
酷。另外,你能谈谈我对社区指南的意见吗?
也没有自动测试。您提供了一个快速教程,但没有记录任何API方法。
公共方法中没有对每个参数的描述。
您可以在此处找到示例:http://rasbt.github.io/biopandas/contension/#how(网址:http://rasbt.github.io/biopandas/contension/#how)-贡献它位于README.md中:https://github.com/rasbt/biopandas#链接您还可以在repo中提供CONTRIBUTING.md文件。
关于可视化工具的自动化测试,@阿丰有什么建议吗?
可视化是HTML格式的吗?如果是这样的话,像硒这样的东西可能很适合吗?
@阿丰这是一个很好的观点,但我认为这对这个项目来说太过分了。从我编写的小前端测试中,我可以看出这将需要2-3倍于我已经编写的代码来编写健壮的UI测试。这个应用程序似乎不需要这样做。你怎么认为?
@zfrenchee-是的,我听到了。自动化测试并不是JOSS的一个固定要求,但如果没有,则需要提供类似的东西(文档化的测试程序和示例数据等)。基本上,审查人员需要能够验证软件的功能。
@阿丰这很有道理。让我看看我能通过测试之类的方式找到什么。
你在@zfrenchee过得怎么样?
刚刚通过电子邮件向@zfrenchee发送了提醒。
我创建了一组简单的示例,演示如何启动和运行此项目:
https://github.com/zfrenchee/NN-SVG/wiki/Tests--Minimal-Examples
通过这些示例,您应该能够绘制NN,并使用API文档中列出的任何显示参数对其进行配置:
https://github.com/zfrenchee/NN-SVG/wiki/NN-SVG-API#iii-风格化网络
我认为一个合理的测试用例是克隆电子回购,复制粘贴一个最小的示例,验证您是否看到NN图,然后使用API以各种方式配置或样式它。
谢谢@zfrenchee。
@特里汤元-你能看看@zfrenchee在这里添加的示例吗https://joss.readthedocs.io/en/latest/review_criteria.html#tests):
可遵循记录的手动步骤客观检查软件的预期功能(例如,断言行为的示例输入文件)
感谢@zfrenchee对这些问题的解决,谢谢@阿丰对于ping。看起来不错。你能回答我之前发表的以下评论吗?
缺少安装说明(这太琐碎了@阿丰我们需要这个吗?)
我想,由于这里的大多数依赖项都是从web上的CDN中提取的JavaScript库,也许我们不需要安装说明?
也就是说,最好在README(或wiki)中明确最终用户需要什么来生成这些数字。
您好!@阿丰,@terrytangyuan公司
“安装说明”:wiki描述了通过CDN隐式包含在最小示例并在API文档
添加到wiki的贡献指南,并链接到自述文件中的。
谢谢。我已经标记了清单中的所有项目。@阿丰现在交给你。
谢谢@特里汤元.
@zfrenchee-此时,您可以在Zenodo/f无花果共享/其他服务中对审查过的软件进行归档,并使用归档的DOI更新此线程吗?然后,我可以继续接受提交的内容。
@阿丰对不起,打扰了,你能告诉我关于这个步骤的更多信息吗?我在上面什么也没看到JOSS提交说明页面,我有点不确定别人问我什么。我听说我应该在zenodo上存档当前代码吗?只需从github下载一个回购zip并上传到zenodo就能实现这一点吗?
我是否正确地听到我应该在zenodo上存档当前代码?只需从github下载一个回购zip并上传到zenodo就能实现这一点吗?
是的,没错。如果您在审查期间对代码库/文档进行了重大更改,那么我们也鼓励您在GitHub上发布新版本。您可以按照本指南学习如何做到这一点:https://guides.github.com/activities/citable-code网站/
谢谢@阿丰
请参见https://zenodo.org/record/2541121#.XD49sM9KjmE和NN-SVG发布页面
@小麦将10.5281/zenodo.2541121设置为存档
好 啊。10.5281/zenodo.2541121是存档。
@小麦接受
正在尝试试运行处理纸张验收。。。
检查最终证明👉openjournals/joss-papers#435
如果PDF和Crossref文档存放XML看起来不错openjournals/joss-papers#435,然后您可以继续接受提交,方法是使用标志再次编译存款=真例如
存款=真
@whedon accept deposit=真
@小麦接受存款=true
现场直播!正在尝试自动处理纸张验收。。。
🚨🚨🚨这不是演习,你刚刚把一篇论文交给了JOSS!🚨🚨🚨
以下是您现在必须执行的操作:
有什么问题吗?通知你的编辑技术团队。。。
@特里汤元-非常感谢你在这里的评论✨
@zfrenchee-你的论文现在被JOSS接受⚡🚀💥
🎉🎉🎉 祝贺你的论文被录取!🎉🎉🎉
如果您想在自述文件中包含论文链接,请使用以下代码片段:
降价:[![DOI](http://joss.theoj.org/papers/10.21105/joss.00747/status.svg)](https://doi.org/10.21105/joss.00747)HTML格式:<a style=“border-width:0”href=“https://doi.org/10.21105/joss.00747"><img src=“http://joss.theoj.org/papers/10.21105/joss.00747/status.svg“alt=”内政部徽章“></a>重新结构化文本:..图像:http://joss.theoj.org/papers/10.21105/joss.00747/status.svg:目标:https://doi.org/10.21105/joss.00747
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像你这样的派对刚刚发表了一篇论文!🎉🌈🦄💃👻🤘
谢谢你的评论,@特里汤元为了得到善意的支持,@阿丰。期待为这个社区做出贡献=)
阿丰
特里汤元
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