QIAGEN由

QIAGEN OmicSoft OncoLand公司

利用癌症基因组数据的肿瘤数据库加速癌症研究

QIAGEN OncoLand是一个具有集成可视化软件的肿瘤学数据库,可帮助癌症研究人员轻松探索高质量的公共和私人癌症基因组数据和癌症数据集。利用QIAGEN世界级的分析管道、癌症数据集管理和数据管理工具,加速您的肿瘤学研究项目——从癌症生物标志物发现、新靶点识别和靶点验证,到药物重新定位和适应症发现。

快速、可扩展的癌症基因组数据和分析

OncoLand肿瘤学数据库几乎用于药物开发的所有阶段(从发现到临床前和临床研究),它包含多组学平台,同时为数据合并提供标准化管道,并提供癌症数据集相关信息的受控词汇表。每个项目都是使用一组广泛的受控词汇表精心策划的,以使数据公平(可查找、可访问、可互操作和可重用)。

  • 广泛支持基因组数据类型和数百个精选和质量控制的公共癌症基因组数据集
  • 强大的可视化和分析功能,可在数据集内和数据集之间进行比较和关联
  • 内部“陆地”下一代数据库技术提供了对大量基因组数据集的快速访问

关注下游研究

无需重新发明轮子:QIAGEN的生物信息学团队每年花费数千小时进行计算、管理和下载,以跟上快速增长的癌症基因组数据,因此您无需如此。通过使用我们预先管理的癌症数据集和强大的分析,您可以:

  • 快速识别高质量、精心管理的肿瘤学数据集
  • 使用可视化癌症基因组工具轻松查询您的数据和我们的数据
  • 组织肿瘤学数据库以符合制药行业数据标准
  • 节省宝贵的时间和资源,同时加强癌症生物标记物研究

“QIAGEN OmicSoft Lands为我节省了很多时间,我专注于测试假设和探索数据,而不是查找、下载、处理和注释单个数据集。”

-博士。Arthur Liberzon,Alkermes公司生物信息学家。

能力

  • 使用QIAGEN OmicSoft OncoLand肿瘤学数据库,从癌症数据集中进行生物学发现的可能性是无限的:

    • 集成最大的公共联盟数据集,包括TCGA、GTEx、Blueprint、CCLE、CGCI、ICGC、TARGET、TRACERx等
    • 支持20多种主要基因组数据类型和数千种临床测量
    • DNA序列、RNA序列、融合、蛋白质表达、拷贝数、甲基化和临床属性的分析和可视化
    • 将内部癌症数据集与公共数据安全集成
    • 将正常组织表达与肿瘤和细胞系数据进行比较(例如,GTEx vs TCGA vs CCLE)
    • 识别疾病内部和跨疾病的突变模式
    • 在核苷酸分辨率上识别顶级基因融合
    • 突变和拷贝数变异与表达相关
    • 定义自定义队列以比较表达式、副本号等

复杂多组元查询的灵活API访问

如果你是一名专注于“经济分析”的数据科学家,你可能会被维护数据湖和构建所需的特定数据所消耗。数据集元数据中的差距和不一致可能会让您感到沮丧,因为这些差异和不一致会导致查询返回误导性结果,从而对您的研究产生负面影响。

通过对QIAGEN OmicSoft数据的API访问,您不再需要查找、摄取和维护包含不一致的公共经济学数据聚合的数据库。相反,您可以通过查询我们统一的“经济学数据库”中的小型或大型数据切片,直接进行数据分析。我们严格的元数据管理方法结合对结构化和集成的经济数据的API访问,允许您执行大型复杂的跨数据库、多经济查询。我们还提供平面文件选项,用于将数据摄取到您自己的数据库或通过我们为“组学可视化”设计的GUI。

特色资源

信息图表

探索我们强大的生物标志物和靶标发现解决方案

小册子

探索QIAGEN OmicSoft OncoLand如何帮助您深入挖掘经济数据以获取新见解

了解QIAGEN OmicSoft OncoLand如何通过手动管理的临床元数据帮助推进TCGA数据探索

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