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短读取长度和重复的基因组区域通常会导致碎片从头组装。为了改进结果并将连续序列转化为高质量的组合,需要一个称为基因组整理的复杂过程。QIAGEN CLC基因组整理模块是QIAGEN CLC基因组学工作台的一个附加模块,旨在加速和简化基因组整理,并使生命科学家在不深入了解生物信息学的情况下可以访问这一过程。

“QIAGEN CLC基因组修饰模块是为修饰较小的基因组而设计的,非常适合组装微生物或真核寄生虫。支架或重叠群连接的自动化工具也可以提高较大基因组组装的结果。手动编辑植物或动物基因组尚不可行。”

马丁·西蒙森博士
生物信息学主管QIAGEN Aarhus,提及模块的用途。

走向高质量参考基因组

基因组整理通常需要耗费大量的工作和时间,并且通常需要专业团队的参与。QIAGEN CLC基因组整理模块让非专业人士快速完成基因组组装。

提高装配质量–快速简便

使用连接轮廓改进从头组装。

一步到位地利用各种整理方法的组合。使用成对读取或长读取(如PacBio)数据构建contigs支架,并自动将contigs相互对齐或与紧密相关的基因组对齐。

更快地组装参考基因组。

PacBio的单分子实时测序平台快速生成数据。数据分析现在是你的瓶颈吗?我们为您提供最快速、最简单的方法来纠正错误,并使用QIAGEN CLC基因组整理模块将PacBio长读数组装成高质量的组件。

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系统要求

有关本产品的系统要求,请参阅相关QIAGEN CLC工作台系统要求.

最新改进

我们经常发布更新和改进,例如新功能、错误修复或插件。要获得完整的概述,请阅读最新改进。

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