斑马鱼ENS转录组与小鼠ENS神经元和ENS胶质细胞的单细胞转录组数据集的比较。(A类)显示樱桃差异表达基因对数2倍变化的散点图+和樱桃-本文中提出的成年斑马鱼体转录组研究中的样本(X轴),以及Zeisel及其同事发布的已发表单细胞数据集中小鼠ENS神经元和ENS胶质细胞差异表达基因的对数倍变化(Zeisel等人,2018年)(Y轴)。中的完整数据补充文件3(另请参见方法和图2——补充图3). 在右下象限中可以找到Cherry+中的基因和小鼠神经元中的基因,示例基因以红色突出显示。在右上象限中,可以找到Cherly+中和小鼠胶质细胞中的基因。示例基因以绿色突出显示。(B类)聚类热图显示了在本研究的成年斑马鱼肠道转录组数据中分析的小鼠ENS神经元中富集的366个基因列表(logFC>0.2小鼠神经元vs.胶质细胞),其斑马鱼同源基因在樱桃+种群中富集(logFC>0,p值≤0.05)。选择显示的基因(完整的基因列表和相应的数据显示在补充文件4). (C类)聚类热图显示了在本研究的成年斑马鱼肠道转录组数据中分析的富含小鼠ENS胶质细胞的63个基因列表(logFC>0.2小鼠胶质细胞vs.神经元),其斑马鱼同源基因在樱桃+种群中富集(logFC>0,p值≤0.05)(完整的基因列表和相应数据显示在补充文件5).
|