赫克托·巴尼奥斯;纳撒尼尔·布西克;露丝·戴维森;格罗斯，伊丽莎白;帕梅拉·哈里斯（Pamela E.Harris）。;罗伯特·克朗;朗，科尔比;艾伦·斯图尔特;罗伯特·沃克 系统发生树。 （英语） Zbl 1483.13002号 J.软件。代数几何。 11, 1-7 (2021). 小结：我们介绍这个包系统发生树对于麦考利2，它允许用户计算基于组的树模型的系统发育不变量。我们提供了一些关于系统发育代数几何的背景信息，并展示了该软件包如何系统发生树可用于计算系统发育理想的生成集及其维数的下限。最后，我们展示了如何使用包中的方法来计算任意两个理想的连接的生成集。 MSC公司： 13-04 与交换代数有关的问题的软件、源代码等 05-04 组合数学相关问题的软件、源代码等 92-04 生物相关问题的软件、源代码等 13第25页 交换代数的应用（例如，统计、控制理论、优化等） 05二氧化碳 树 14米25 双曲面、牛顿多面体、Okounkov体 92D15型 与进化有关的问题 13层65 由二项式理想、复曲面环等定义的交换环。 关键词：系统发育树;割线理想;代数统计学;复曲面理想 软件：麦考利2;系统发生树 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{H.Baños}等人，J.Softw。代数几何。11、1--7（2021；Zbl 1483.13002） 全文： 内政部 arXiv公司 参考文献： [1] 10.1093/oxfordjournals.molbev.a040433·doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a040433 [2] 10.1093/sysbio/sys064·doi:10.1093/sysbio/sys064 [3] 10.1109/TCBB.2010.79·doi:10.1109/TCBB.2010.79 [4] 10.1214/aos/1176349030·Zbl 0772.92012号 ·doi:10.1214/aos/1176349030 [5] 2016年10月10日/j.aam.2014.12.003·Zbl 1307.92013年9月 ·doi:10.1016/j.am.2014.12.003 [6] 10.1080/10635150701627304 ·网址：10.1080/10635150701627304 [7] 10.1007/s11538-007-9293年·Zbl 1144.92033号 ·doi:10.1007/s11538-007-9293-y [8] 2007年10月10日/11538-011-9672-2·Zbl 1238.92034号 ·doi:10.1007/s11538-011-9672-2 [9] ; Rusinko，分子生物学算法，7（2012） [10] 2008年10月10日·doi:10.1090/ulect/008 [11] 10.1089/cmb.2005.12.04·Zbl 1391.13058号 ·doi:10.1089/cmb.2005.12.04 [12] 10.4310/PAMQ.2006.v2.n3.a12·Zbl 1107.14045号 ·doi:10.4310-PAMQ.2006.v2.n3.a12 [13] 2016年10月10日/j.jalgebra.2006.10.004·Zbl 1129.13030号 ·doi:10.1016/j.jalgebra.2006.10.004 [14] 10.1016/0893-9659(93)90004-7 ·兹比尔0776.60016 ·doi:10.1016/0893-9659（93）90004-7 [15] ; A.Terracini，伦德。循环。马特·巴勒莫（1911） 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。