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弗雷德里克·马森。;埃尔沙南·莫塞尔;斯蒂尔，迈克

混合树：系统发育混合物的结构。 （英语） Zbl 1144.92033号

牛。数学。生物。 70，第4期，1115-1139（2008）.
摘要：我们将新的几何和组合方法应用于系统发育混合物的研究。几何方法的重点是描述两态随机簇模型的系统发育混合分布的几何，这是两态对称（CFN）模型的推广。特别地，我们证明了混合分布集形成了一个凸多面体，并计算了它的维数；推论包括一个简单的准则，用于判断星形树上分支长度的混合物何时可以模拟已解析四叉树的站点模式频率矢量。
此外，通过计算多面体的体积，我们可以阐明CFN模型下“常见”的不可识别混合物是如何存在的。我们还提出了一个新的组合结果，该结果将大小为6的特定树对的任何可识别结果扩展到任意树对。接下来，我们给出了一个积极的结果，表明跨侧模型的费率可识别性。最后，我们回答了前面一篇文章中提出的关于CFN模型下大于四叉树的树的“混合分支排斥”的问题。

引用于11文件

MSC公司：

92D15型 与进化有关的问题
52号B11 \（n）维多面体
05二氧化碳 树
52B99号 多面体和多面体

关键词：

系统发育学;模型可识别性;混合物模型;多面体;离散傅里叶分析

软件：

多晶的
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{F.A.Matsen}等人，公牛。数学。生物70，编号4，1115--1139（2008；Zbl 1144.92033）
全文： 内政部 arXiv公司

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