2021年第11卷第1期

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系统发育

赫克托·巴尼奥斯(Hector Baños)、纳撒尼尔·布歇克(Nathaniel Bushek)、露丝·戴维森(Ruth Davidson)、伊丽莎白(Elizabeth)格罗斯、帕梅拉·哈里斯、罗伯特·克龙、科尔比·朗、艾伦斯图尔特和罗伯特·沃克

第11卷(2021年),1-7
摘要

我们推出套餐系统发育树对于麦考利2,它允许用户计算基于组的树模型的系统发育不变量。我们提供一些系统发育代数几何的背景信息,并说明包裹系统发生树可用于计算系统发育理想及其维度的下限。最后,我们展示了如何包中的方法可用于计算任何两种理想。

关键词
系统发育树、割线理想、代数统计、,复曲面理想
2010年数学学科分类
初级:13P25
次级:05C05、14M25、92D15
补充材料

不变式用于基于组的系统发育模型

里程碑
收到日期:2016年11月16日
修订日期:2020年1月4日
接受日期:2020年8月8日
发布日期:2022年2月20日
作者
赫克托·巴尼奥斯
数学学院
乔治亚理工学院
佐治亚州亚特兰大
美国
纳撒尼尔·布什克
数学与数学系物理学
圣学院
明尼苏达州德卢斯
美国
露丝·戴维森
数学系
伊利诺伊香槟分校
伊利诺伊州乌尔班纳
美国
伊丽莎白·格罗斯
数学系
夏威夷大学马诺分校
火奴鲁鲁,夏威夷
美国
帕梅拉·哈里斯
数学与数学系统计
威廉姆斯学院
马萨诸塞州威廉斯敦
美国
罗伯特·克朗
数学系
加州大学戴维斯分校
加利福尼亚州戴维斯
美国
科尔比·朗
数学与数学系计算科学
伍斯特学院
大学街东308号
俄亥俄州伍斯特44691
美国
艾伦·斯图尔特
数学系
西雅图大学
华盛顿州西雅图
美国
罗伯特·沃克
数学系
威斯康星大学麦迪逊分校
威斯康星州麦迪逊
美国