SIMA公司 swMATH ID: 19189 软件作者： Kaifosh，P.、Zaremba，J.D.、Danielson，N.B.、Losonczy，A。 描述： SIMA：用于分析动态荧光成像数据的Python软件。荧光成像是监测神经系统动态信号的有力方法。然而，动态荧光成像数据的分析仍然繁重，部分原因是缺乏可用的软件工具。为了满足这一需求，我们开发了SIMA，这是一个开放源码的Python包，它有助于与荧光成像相关的常见分析任务。该软件包的功能包括校正激光扫描显微镜体内成像过程中出现的运动伪影，将成像场分割为感兴趣区域（ROI），以及从分割的ROI中提取信号。我们还开发了一个图形用户界面（GUI），用于手动编辑自动分割的ROI，并在多个成像数据集上自动注册ROI。该软件在设计时考虑到了灵活性，以允许未来使用不同的分析方法进行扩展，并可能与其他软件包集成。SIMA软件包和ROI Buddy GUI的软件、文档和源代码可在以下网站免费获得：http://www.losonczylab.org/sima/。 主页： http://www.losonczylab.org/sima 关键词： SIMA公司;顺序IMage分析;开放源代码;时间序列成像数据;荧光显微镜;Python包 相关软件： 套房2p;蟒蛇;HNCcorr公司;图像浏览器;罗曼诺工具箱;加利福尼亚州;DoOR（道尔）;简单弹性体;莫科;ILTIS公司;斐济;OpenFluo软件;卡伊曼;PyView（虚拟视图）;神经探测仪;转换2d;Matlab公司 引用于： 1文件 3位作者引用 1 罗伯托·阿辛·阿查 1 多里特·霍奇鲍姆。 1 斯潘，基科 连载1篇 1 运筹学年鉴 在1个字段中引用 1 运筹学、数学规划（90-XX） 按年份列出的引文