卡伊曼 swMATH ID: 35877 软件作者： Giovannucci，A.、Friedrich，J.、Gunn，P.、Kalfon，J.，Brown，B.L.、Koay，S.A.等人。 描述： CaImA是一个用于可扩展钙成像数据分析的开源工具。荧光显微术的进展使在体监测更大的脑区具有更高的时间分辨率。由此产生的数据速率需要可重复的分析管道，这些管道可靠、完全自动化，并可扩展到数月内生成的数据集。我们介绍了CaImAn，一个用于钙成像数据分析的开源库。CaImAn提供了自动和可扩展的方法来解决预处理常见的问题，包括运动校正、神经活动识别和跨不同数据采集会话的注册。它做到了这一点，同时需要最少的用户干预，在从笔记本电脑到高性能计算集群的计算机上具有良好的可扩展性。CaImAn适用于双光子和单光子成像，还可以对流数据进行实时分析。为了对CaImAn的性能进行基准测试，我们收集并合并了九个鼠标双光子数据集上多个标签的手动注释语料库。我们证明，CaImAn在检测活动神经元位置方面达到了接近人类的性能。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6342523/ 源代码： https://github.com/flatironinstitute/CaImAn网站 依赖项： 蟒蛇 相关软件： 套房2p；SIMA公司；图像浏览器；罗曼诺工具箱；加利福尼亚州；DoOR（道尔）；简单弹性体；莫科；ILTIS公司；斐济；OpenFluo软件；蟒蛇；PyView（虚拟视图）；PRMLT公司；LZeroSpike推断 引用于： 2文件 全部的 前5名8位作者引用 1 阿德勒，Avital 1 陈哲石 1 福岛，川崎 1 甘文彪 1 广岛市Kohsaka 1 鼻子，Akinao 1 屠梦玉 1 赵若河 2篇连载文章中引用 1 神经网络 1 神经计算 在1个字段中引用 2 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文