外汇 swMATH ID: 12023 软件作者: D.Hong、A.Rhie、S.-S.Park等人。 描述: FX:云上的RNA-Seq分析工具。FX是一种RNA-Seq分析工具,在云计算基础设施上并行运行,用于估计基因表达水平和基因组变异调用。在短RNA-Seq读数的映射中,FX主要使用基于转录组的参考,从RefSeq、UCSC和Ensembl数据库中的16万mRNA序列生成。这种方法减少了来自拼接接头的读取不对准。未在已知转录物上对齐的未映射读取然后映射到人类基因组参考。FX允许分析云计算基础设施上的RNA-Seq数据,支持通过用户友好的web界面访问。可用性:FX可在网站上免费获得(http://fx.gmi.ac.kr),可以安装在本地Hadoop集群上。FX的安装和操作指南可在网站的“文档”菜单下找到。 主页: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/28/5/721 相关软件: 普罗瓦林;十字弓;k平均值++;经济学;T-咖啡;卡林;肌肉;CloudAligner(云对齐器);云爆发(CloudBurst);印章;埃乌尔桑;Hadoop总线;SeqWare软件;关贸总公司;RF女士;肥皂3;ClustalW公司;DIALIGN公司;探针Cons;CloudBLAST(云爆炸) 引用于: 1文件 由3位作者引用 1 朱拉特·道格莱特 1 奥德里斯科尔,艾斯林 1 罗伊·D·斯莱特。 连载1篇 1 ISRN生物数学 在1个字段中引用 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文