3ZGC公司

KEAP1-NEH2配合物的晶体结构


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:2.20 Å
  • R值自由:0.188 
  • R值工作:0.172 
  • 观察到的R值:0.173 

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文学类

晶体接触工程,以获得适合配体浸泡实验的人类Keap1 Kelch结构域的晶体形式。

霍勒,S。雷内特,D。奥斯特曼,K。霍夫尔斯,Y。Nar,H。

(2013)Acta Crystallogr Section F Struct Biol Cryst Commun公司69: 592

  • 内政部:https://doi.org/10.107/S174430911301124X
  • 相关结构的主要引文:
    3ZGC公司,3ZGD公司

  • PubMed摘要:

    Keap1是Cul3依赖性泛素连接酶复合物的底物衔接蛋白,在细胞对氧化应激的反应中发挥重要作用。它将Nrf2与其Kelch结构域结合,从而触发Nrf2的泛素化和降解。氧化应激可阻止Nrf2的降解,并导致细胞保护基因的激活。因此,Keap1是治疗炎症性疾病的一个有吸引力的药物靶点。通过结构研究支持药物化学研究需要一个坚固的结晶系统,其中晶体最好适合进行浸泡实验。这有助于以常规和高通量的方式生成蛋白-甘氨酸复合物。人类Keap1的结构已在前面描述过。然而,在这种晶体形式中,Nrf2的结合位点被晶体接触阻断。分析了这种相互作用,并引入突变来破坏这种晶体接触。一个双突变(E540A/E542A)以新的晶体形式结晶,其中Nrf2的结合位点没有被阻断,并且可被小分子配体接近。报道了突变Keap1-Kelch结构域的apo形式的晶体结构(1.98Å分辨率)和通过浸泡获得的与Nrf2衍生肽的复合物的晶体结构(2.20Å分辨率)。


  • 组织附属关系

    领导识别和优化支持部,德国比伯拉赫88400,Birkendorferstrasse 65,Boehringer Ingelheim Pharma GmbH and Co KG。


大分子
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
类KELCH ECH相关蛋白1310智人突变: 2 
UniProt&NIH共同基金数据资源
寻找蛋白质问题14145 (智人)
探索问题14145 
转到UniProtKB:问题14145
PHAROS公司:问题14145
GTEx公司:ENSG0000079999号 
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团问题14145
序列注释
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  • 参考序列

通过序列| 3D结构查找类似蛋白质

实体ID:2
分子链条序列长度有机体细节图像
核因子类红细胞2相关因子27智人突变: 1 
UniProt&NIH共同基金数据资源
寻找蛋白质问题16236 (智人)
探索问题16236 
转到UniProtKB:问题16236
PHAROS公司:问题16236
实体组 
UniProt集团问题16236
序列注释
展开
  • 参考序列
实验数据与验证

实验数据

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:2.20 Å
  • R值自由:0.188 
  • R值工作:0.172 
  • 观察到的R值:0.173 
  • 空间组:第2页12121
单位单元格:
长度(Å)角度(˚)
a=76.103α = 90
b=76.064β = 90
c=207.541γ = 90
软件包:
软件名称目的
巴斯特精炼
XDS公司数据缩减
标量数据缩放
相位器阶段划分

结构验证

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  • 版本1.0:2013-06-12
    类型:首次发布
  • 版本1.1:2018-06-20
    更改:咨询、数据收集、衍生计算
  • 版本1.2:2023-12-20
    更改:数据收集、数据库引用、派生计算、其他、优化描述