6O7伏

酿酒酵母V-ATP酶Stv1-V1VO状态1


实验数据快照

  • 方法:电子显微镜
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文学

酿酒酵母液泡和高尔基V-ATP酶的结构比较。

瓦桑塔库玛,T。Bueler,S.A.公司。D.吴。贝尔斯滕·埃德曼德,V。C.V.罗宾逊。鲁宾斯坦,J.L。

(2019)美国国家科学院院刊116: 7272-7277

  • 内政部:https://doi.org/10.1073/pnas.1814818116
  • 相关结构的主要引文:
    6O7吨,6O7件,6O7伏,6O7瓦,6O7倍

  • PubMed摘要:

    质子转运空泡型ATP酶(V-ATP酶)是真核细胞中许多过程所必需的,包括受体介导的内吞、蛋白质成熟和溶酶体酸化。在哺乳动物中,V-ATP酶亚基亚型不同地针对不同的细胞内隔间或组织,但这些亚基亚型别如何影响酶活性尚不清楚。在酵母中酿酒酵母,亚型多样性仅限于两种不同版本的质子转位亚单位a:Vph1p,靶向液泡,Stv1p,定位于高尔基体和内体。我们发现含有Vph1p的纯化的V-ATP酶复合物比含有Stv1p的复合物具有更高的ATP酶活性,并且活性的相对差异取决于脂质的存在。我们还展示了VO(运行)含有Stv1p的配合物可以很容易地纯化,而不需要附加V1区域。我们利用这种效应来确定膜嵌入V的结构O(运行)Stv1p的区域分辨率为3.1-Ω,我们将其与V的结构进行比较O(运行)Vph1p区域,我们确定其分辨率为3.2Ω。这些图谱揭示了细胞质质子半通道附近表面电荷的差异。这两张图还显示了c环周围结合脂质的存在,以及可能与麦角固醇或结合洗涤剂相对应的规则间隔密度。


  • 组织附属关系

    分子医学项目,加拿大安大略省多伦多市生病儿童医院,邮编:M5G 0A4。


大分子
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
V型质子ATP酶亚基DA[认证M]256酿酒酵母S288C突变: 0 
膜实体:是的 
UniProt公司
寻找蛋白质第32610页 (酿酒酵母(菌株ATCC 204508/S288c))
探索第32610页 
转到UniProtKB:第2610页
实体组 
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UniProt集团第2610页
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通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:2
分子链条序列长度有机体细节图像
V型质子ATP酶亚基FB[认证编号]118酿酒酵母S288C突变: 0 
膜实体:是的 
UniProt公司
寻找蛋白质第39111页 (酿酒酵母(菌株ATCC 204508/S288c))
探索第39111页 
转到UniProtKB:第39111页
实体组 
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UniProt集团第39111页
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  • 参考序列
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:3
分子链条序列长度有机体细节图像
液泡ATP合成酶催化亚单位AC[认证A],
E[认证C],
G[认证E]
639酿酒酵母RM11-1a突变: 0 
UniProt公司
寻找蛋白质B3LH69型 (酿酒酵母(菌株RM11-1a))
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实体组 
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UniProt集团B3LH69型
序列注释
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  • 参考序列
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:4
分子链条序列长度有机体细节图像
V型质子ATP酶亚基BD[认证B],
F[认证D],
H[认证F]
517酿酒酵母S288C突变: 0 
膜实体:是的 
UniProt公司
寻找蛋白质第16140页 (酿酒酵母(菌株ATCC 204508/S288c))
探索第16140页 
转到UniProtKB:第16140页
实体组 
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UniProt集团第16140页
序列注释
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  • 参考序列
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:5
分子链条序列长度有机体细节图像
V型质子ATP酶亚基G本人[授权L],
M[身份验证H],
O[授权J]
114酿酒酵母S288C突变: 0 
膜实体:是的 
UniProt公司
寻找蛋白质第48836页 (酿酒酵母(菌株ATCC 204508/S288c))
探索第48836页 
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实体组 
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UniProt集团第48836页
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  • 参考序列
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:6
分子链条序列长度有机体细节图像
V型质子ATP酶亚基EJ[认证K],
N[身份验证G],
P[认证I]
233酿酒酵母S288C突变: 0 
膜实体:是的 
UniProt公司
寻找蛋白质第22203页 (酿酒酵母(菌株ATCC 204508/S288c))
探索第22203页 
转到UniProtKB:第22203页
实体组 
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UniProt集团第22203页
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  • 参考序列
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:7
分子链条序列长度有机体细节图像
V型质子ATP酶亚基HK[认证P]478酿酒酵母S288C突变: 0 
膜实体:是的 
UniProt公司
寻找蛋白质第41807页 (酿酒酵母(菌株ATCC 204508/S288c))
探索第41807页 
转到UniProtKB:第41807页
实体组 
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UniProt集团第41807页
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  • 参考序列
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:8
分子链条序列长度有机体细节图像
V型质子ATP酶亚基CL[授权O]392酿酒酵母S288C突变: 0 
膜实体:是的 
UniProt公司
寻找蛋白质第31412页 (酿酒酵母(菌株ATCC 204508/S288c))
探索第31412页 
转到UniProtKB:第1412页
实体组 
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UniProt集团第1412页
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通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:9
分子链条序列长度有机体细节图像
V型质子ATP酶亚基a,高尔基亚型Q[认证]890酿酒酵母S288C突变: 0 
膜实体:是的 
UniProt公司
寻找蛋白质第37296页 (酿酒酵母(菌株ATCC 204508/S288c))
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实体组 
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UniProt集团第37296页
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  • 参考序列
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:10
分子链条序列长度有机体细节图像
V0组装蛋白1R[授权b]265酿酒酵母突变: 0 
膜实体:是的 
UniProt公司
寻找蛋白质第53262页 (酿酒酵母(菌株ATCC 204508/S288c))
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实体组 
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UniProt集团第53262页
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通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:11
分子链条序列长度有机体细节图像
V型质子ATP酶亚基c’’S[授权]213酿酒酵母突变: 0 
膜实体:是的 
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寻找蛋白质第23968页 (酿酒酵母(菌株ATCC 204508/S288c))
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UniProt集团第23968页
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通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:12
分子链条序列长度有机体细节图像
V型质子ATP酶亚基dT[授权]345酿酒酵母S288C突变: 0 
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寻找蛋白质第32366页 (酿酒酵母(菌株ATCC 204508/S288c))
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UniProt集团第32366页
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实体ID:13
分子链条序列长度有机体细节图像
V型质子ATP酶亚基c160酿酒酵母S288C突变: 0 
膜实体:是的 
UniProt公司
寻找蛋白质第25515页 (酿酒酵母(菌株ATCC 204508/S288c))
探索第25515页 
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实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团第25515页
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  • 参考序列
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:14
分子链条序列长度有机体细节图像
V型质子ATP酶亚基c'CA[授权]164酿酒酵母S288C突变: 0 
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UniProt公司
寻找蛋白质第32842页 (酿酒酵母(菌株ATCC 204508/S288c))
探索第32842页 
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序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团第32842页
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通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:15
分子链条序列长度有机体细节图像
V型质子ATP酶亚单位eDA[授权]73酿酒酵母S288C突变: 0 
膜实体:是的 
UniProt公司
寻找蛋白质问题3E7B6 (酿酒酵母(菌株ATCC 204508/S288c))
探索问题3E7B6 
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实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团问题3E7B6
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  • 参考序列
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:16
分子链条序列长度有机体细节图像
推测蛋白YPR170W-BEA[授权f]85酿酒酵母S288C突变: 0 
薄膜实体:是的 
UniProt公司
寻找蛋白质P0C5R9型 (酿酒酵母(菌株ATCC 204508/S288c))
探索P0C5R9型 
转到UniProtKB:P0C5R9型
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序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团P0C5R9型
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  • 参考序列
实验数据和验证

实验数据

  • 方法:电子显微镜
  • 分辨率:6.60 Å
  • 聚合状态:颗粒
  • 重建方法:单颗粒

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加拿大卫生研究院(CIHR)加拿大81294澳门元

修订历史记录(完整详细信息和数据文件)

  • 版本1.0:2019-04-03
    类型:首次发布
  • 版本1.1:2019-04-10
    更改:数据收集、数据库引用
  • 版本1.2:2019-04-24
    更改:数据收集、数据库引用
  • 版本1.3:2020-01-15
    更改:作者支持证据
  • 版本1.4:2024-03-20
    更改:数据收集、数据库引用