3个RBH

铜绿假单胞菌藻酸盐输出蛋白AlgE的结构

PDB内政部：https://doi.org/10.2210/pdb3RBH/pdb

分类：转运蛋白
生物体：铜绿假单胞菌
表达式系统：大肠杆菌
突变：没有
膜蛋白：是的 OPM公司PDBTM公司MemProtMD公司

存款：2011-03-29 发布时间：2011-07-27
存款作者：J.C.惠特尼。,海伊，I.D。,李，C。,P.D.埃克福德。,罗宾逊，H。,M.F.阿马亚。,木材，L.F。,D.E.奥曼。,熊，C.E。,雷姆，B.H。,豪厄尔，P.L。

实验数据快照

方法：X射线衍射
分辨率：2.30 Å
R值自由：0.259
R值工作：0.221
观察到的R值：0.223

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文学类

细菌外膜海藻酸分泌的结构基础。

J.C.惠特尼。, 海伊，I.D。, 李，C。, 埃克福德，P.D。, Robinson，H。, Amaya，医学博士。, 木材，L.F。, D.E.奥曼。, 熊，C.E。, 雷姆，B.H。, 林恩·豪厄尔（Lynne Howell），P。

（2011）美国国家科学院院刊108: 13083-13088

公共医学: 21778407 在PubMed上搜索在PubMed Central上搜索
内政部：https://doi.org/10.1073/pnas.1104984108
相关结构的主要引文：
3个RBH

PubMed摘要：
铜绿假单胞菌是囊性纤维化患者中与慢性肺部感染相关的主要病原体。在肺部定植过程中，铜绿假单胞菌转化为以胞外多糖藻酸盐过度生成为特征的粘液表型。新合成的海藻酸通过外膜分泌被认为是通过外膜蛋白AlgE发生的。这里我们报道了AlgE的2.3μl晶体结构，它显示了一个单体18链β-桶，其特征是由富含精氨酸的管道形成的高电正性孔收缩，该管道可能充当负电荷海藻酸钠聚合物的选择性过滤器。有趣的是，两侧的孔收缩被细胞外环L2和异常长的周质环T8所阻断。在卤化物流出分析中，与野生型或ΔL2-AlgE相比，环T8（ΔT8-AlgE）的缺失导致阴离子通量增加了三倍，支持了AlgE通过膜形成转运途径的观点，并表明转运受T8调节。体内实验进一步支持了该模型，实验表明，algE缺失突变体与ΔT8-algE互补会损害褐藻酸盐的生成。综上所述，这些研究支持一种跨外膜的胞外多糖输出机制，该机制与典型荚膜多糖输出系统中观察到的Wza介导的易位不同。

组织附属关系

:

分子结构与功能，加拿大安大略省多伦多市儿童医院，M5G 1X8。

高分子含量

结构总重量：225.67 kDa
原子数：14038
模拟残留物计数：1676
沉积残留物计数：1916
独特的蛋白质链：1

大分子

通过以下方法查找类似蛋白质：

（通过身份截止）|3D结构

实体ID:1
分子	链条	序列长度	有机体	细节	图像
海藻酸盐生产蛋白AlgE	A类,B类,C类,D类	479	铜绿假单胞菌	突变: 0 基因名称：代数E, alg76型, PA3544型膜实体：是的
UniProt公司
寻找蛋白质第18895页（铜绿假单胞菌（ATCC 15692/DSM 22644/CIP 104116/JCM 14847/LMG 12228/1C/PRS 101/PAO1菌株）探索第18895页转到UniProtKB：第18895页
实体组
序列簇	30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团	第18895页
序列注释展开
参考序列

小分子

配体3独特
身份证件	链条	姓名/配方/InChI密钥	二维示意图	3D交互
C8E公司 C8E查询下载理想坐标CCD文件 SDF格式，链AA[auth B] SDF格式，链BA[auth B] SDF格式，链CA[auth B] SDF格式，链SA[auth C] SDF格式，链AB[auth D] SDF格式，链BB[auth D] SDF格式，链CB[auth D] SDF格式，链DA[auth B] SDF格式，链数据库[auth D] SDF格式，链EA[auth B] SDF格式，链EB[auth D] SDF格式，链FA[auth B] SDF格式，链FB[auth D] SDF格式，链GB[auth D] SDF格式，链HB[auth D] SDF格式，链IB[auth D] SDF格式，链L[auth A] SDF格式，链M[auth A] SDF格式，链N[auth A] SDF格式，链O[auth A] SDF格式，链OA[auth C] SDF格式，链PA[auth C] SDF格式，链QA[auth C] SDF格式，链RA[auth C] SDF格式，链TA[auth C] SDF格式，链Y[auth B] SDF格式，链YA[auth D] SDF格式，链Z[auth B] SDF格式，链ZA[auth D] MOL2格式，链AA[auth B] MOL2格式，链BA[auth B] MOL2格式，链CA[auth B] MOL2格式，链SA[auth C] MOL2格式，链AB[auth D] MOL2格式，链BB[auth D] MOL2格式，链CB[auth D] MOL2格式，链DA[auth B] MOL2格式，链数据库[auth D] MOL2格式，链EA[auth B] MOL2格式，链EB[auth D] MOL2格式，链FA[auth B] MOL2格式，链FB[auth D] MOL2格式，链GB[auth D] MOL2格式，链HB[auth D] MOL2格式，链IB[auth D] MOL2格式，链L[auth A] MOL2格式，链M[auth A] MOL2格式，链N[auth A] MOL2格式，链O[auth A] MOL2格式，链OA[auth C] MOL2格式，链PA[auth C] MOL2格式，链QA[auth C] MOL2格式，链RA[auth C] MOL2格式，链TA[auth C] MOL2格式，链Y[auth B] MOL2格式，链YA[auth D] MOL2格式，链Z[auth B] MOL2格式，链ZA[auth D]	AA[认证B] AB【认证D】 BA【认证B】 BB[认证D] CA[认证B] AA[认证B]， AB【认证D】， BA【认证B】， BB[认证D]， CA[认证B]， CB[认证D]， DA【授权B】，数据库[auth D]， EA[认证B]， EB[身份验证D]， FA[认证B]， FB[认证D]， GB[auth D]， HB[认证D]， IB[认证D]， L[认证A]， M[认证A]， N[认证A]， O[认证A]， OA[认证C]， PA【认证C】， QA[认证C]， RA[认证C]， SA[身份验证C]， TA[认证C]， Y[认证B]， YA[认证D]， Z[认证B]， ZA[认证D]	（羟乙基氧基）三（乙氧基）辛烷 C类₁₆H（H）₃₄O（运行）₅ FEOZZFHAVXYAMB-UHFFFAOYSA-N公司		互动焦点链AA[auth B] 焦点链AB[auth D] 焦点链BA[auth B] 焦点链BB[auth D] 焦点链CA[认证B] 焦点链CB[auth D] 焦点链DA[auth B] 焦点链数据库[auth D] 焦点链EA[auth B] 焦点链EB[auth D] 焦点链FA[auth B] 焦点链FB[auth D] 焦点链GB[auth D] 焦点链HB[auth D] 焦点链IB[auth D] 焦点链L[auth A] 焦点链M[auth A] 焦点链N[auth A] 焦点链O[auth A] 焦点链OA[auth C] 焦点链PA[auth C] 焦点链QA[auth C] 聚焦链RA[身份验证C] 焦点链SA[身份验证C] 焦点链TA[auth C] 焦点链Y[auth B] 焦点链YA[auth D] 焦点链Z[auth B] 焦点链ZA[auth D] 相互作用和密度焦点链AA[auth B] 焦点链AB[auth D] 焦点链BA[auth B] 焦点链BB[auth D] 焦点链CA[认证B] 焦点链CB[身份验证D] 焦点链DA[auth B] 焦点链数据库[auth D] 焦点链EA[auth B] 焦点链EB[auth D] 焦点链FA[auth B] 焦点链FB[auth D] 焦点链GB[auth D] 焦点链HB[auth D] 焦点链IB[auth D] 焦点链L[auth A] 焦点链M[auth A] 焦点链N[auth A] 焦点链O[auth A] 焦点链OA[auth C] 焦点链PA[auth C] 焦点链QA[auth C] 焦点链RA[auth C] 焦点链SA[auth C] 焦点链TA[auth C] 焦点链Y[auth B] 焦点链YA[auth D] 焦点链Z[auth B] 焦点链ZA[auth D]
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加利福尼亚州 CA查询下载理想坐标CCD文件 SDF格式，链E[auth A] SDF格式，链GA[auth C] SDF格式，链P[auth B] SDF格式，链UA[auth D] MOL2格式，链E[auth A] MOL2格式，链GA[auth C] MOL2格式，链P[auth B] MOL2格式，链UA[auth D]	E[认证A]， GA[认证C]， P[认证B]， UA[认证D]	钙离子钙 BHPQYMZQTOCNFJ-UHFFFAOYSA-N公司		互动焦点链E[auth A] 焦点链GA[auth C] 焦点链P[认证B] 焦点链UA[auth D] 相互作用和密度焦点链E[auth A] 焦点链GA[auth C] 焦点链P[认证B] 焦点链UA[auth D]

改性残留物 1独特
身份证件	链条	类型	公式	二维示意图	起源
MSE公司 MSE查询	A、 B、C、D	L-肽连接	C类₅H（H）₁₁否₂硒		遇见

实验数据与验证

实验数据

方法：X射线衍射
分辨率：2.30Å
R值自由：0.259
R值工作：0.221
观察到的R值：0.223
空间组：C 1 2 1

单位单元格以下为：

长度（Ω）	角度（˚）
a=162.018	α = 90
b=90.696	β = 107.65
c=160.279	γ = 90

软件包：

软件名称	目的
HKL-2000	数据收集
解决方案	阶段划分
菲尼克斯	精炼
HKL-2000	数据缩减
HKL-2000	数据缩放

结构验证

查看完整验证报告

配体结构质量评估

进入历史记录

存款数据

发布日期：2011-07-27

存款作者：

惠特尼，J.C。

,

海伊，I.D。

,

,

P.D.埃克福德。

,

罗宾逊，H。

,

M.F.阿马亚。

,

木材，L.F。

,

,

,

雷姆，B.H。

,

豪厄尔，P.L。

修订历史记录（完整详细信息和数据文件）

版本1.0:2011-07-27
类型：首次发布
版本1.1:2011-08-24
更改：数据库引用

RCSB PDB核心业务由这个美国国家科学基金会（DBI-2321666），这个美国能源部（数据元素-SC0019749），和国家癌症研究所,国家过敏和传染病研究所,和国家普通医学科学研究所的美国国立卫生研究院拨款R01GM133198。