铜绿假单胞菌#700

应变概述
生物体名称 铜绿假单胞菌#700
物种 铜绿假单胞菌
应变 #700
描述/标题
注释基因 6779
部分基因 64
主机信息
宿主物种疾病 非囊性纤维化
地理位置
位置名称 中国
隔离源 痰
纬度/经度 北纬30.28度，东经120.15度
示例提供程序
姓名 胡燕燕
电子邮件 yanyanhu@zju.edu.cn
机构 浙江大学附属第二医院
收集日期 2021

MLST数据

数据库 方案 序列类型 等位基因
公共MLST 小儿麻痹症 235
mutL公司
13		 邻氨基苯甲酸合成酶
4		 第二版A
2		 数字
1		 acsA公司
38		 瓜阿
三		 aroE公司
11
可用时，菌株具有MLST序列类型。它们目前基于PubMLST网站上的方案(网址：https://pubmlst.org/)由Keith Jolley（Jolley&Maiden 2010，BMC生物信息学，11:595）开发，由Torsten Seemann（Github）开发的“mlst”软件预测https://github.com/tsemann/mst).
装配
组件数据库
参考序列
程序集访问
GCF_030688825.1号
程序集状态 最新的
脚手架 6
轮廓
康蒂格N50 6918355
程序集级别 康蒂格
GC百分比
交叉引用
NCBI生物样本获取 SAMN36630189号
NCBI分类ID 287
NCBI生物项目
相关数据
其他基因组项目信息
排序信息
基因组组装信息
细节

带注释的要素

功能 计数
基因 6779
客户尽职调查 6710
伪 86
tRNA 65
rRNA 12
新冠核糖核酸 5
tmRNA 1

复制副本

6个复制子与此程序集关联

下载序列

基因组学 ORF DNA 内生的 氨基酸

下载基因注释

TSV公司 CSV公司 GBK公司 恩布尔 GFF3型 GFF3+序列 全球贸易基金