简单搜索
使用基因/蛋白质名称或基因的位点标签搜索基因组注释
通过指定特定的菌株或物种进一步缩小结果范围。
高级注释搜索
使用更广泛的搜索字段搜索注释,包括函数、GO术语、路径名称、PMID和交叉引用。
返回具有转座子突变体、人类同源物、3D结构或已知药物靶点的基因列表。
返回特定亚细胞定位的基因列表
返回具有指定基因长度范围的基因列表
路径注释
使用各种方法(例如手动筛选、通过序列相似性自动分配等)对从多个来源获得的路径进行菌株特定搜索。
路径数据来源包括KEGG、PseudoCAP、PseduoCyc和UniPathway。
基因本体论术语注释
返回使用各种方法(例如手动管理、按序列相似性自动分配等)从多个来源获得的GO注释的特定于菌株的列表。
批注更新日志
搜索所有基于人工管理的注释更新日志,主要是那些涉及铜绿假单胞菌PAO1基因组的注释更新。
如果您使用过此数据库,请确保您认可最新的假单胞菌基因组数据库出版物,而不仅仅是网站URL。谢谢!
Winsor GL、Griffiths EJ、Lo R、Dhillon BK、Shay JA、Brinkman FS(2016)。用于比较假单胞菌基因组数据库中数千个假单胞杆菌基因组的增强注释和功能。
假单胞菌基因组数据库由以下人员管理:
这个布林克曼实验室在西蒙·弗雷泽大学
数据库开发由以下主要资金支持:
囊性纤维化基金会,治疗学