针对一个或多个菌株的DIAMOND BLASTP搜索(蛋白质与蛋白质)

使用此表单可以针对更广泛的分类群和数百万个蛋白质快速查询蛋白质序列。

DIAMOND BLASTP命令可以用作BLASTP搜索的快速而敏感的替代方法。使用氨基酸查询序列,它可以比BLASTP快数百倍地搜索蛋白质序列数据库。

有关DIAMOND的更多详细信息,请访问开发者网站或在以下出版物中:

Benjamin Buchfink,Chao Xie和Daniel H.Huson(2015)。
使用DIAMOND进行快速灵敏的蛋白质比对
《自然方法》,12,59–60(2015)doi:10.1038/nmeth.3176。
项目管理标识号:25402007

在这个网站上,您可以使用DIAMOND BLASTP根据蛋白质序列数据库查询氨基酸序列。对于搜索大型数据集(例如,此数据库中所有菌株的蛋白质序列),这是唯一可用的选项。

注2:如果您喜欢使用BLASTP,可以对单个隔离执行BLASTP搜索在这里.

开始键入并从一个分类组中进行选择

包括所有基因组仅包括完整基因组

或者开始键入并选择单个菌株

指定自定义对齐选项(可选)

以FASTA格式粘贴单个氨基酸序列