您可以通过多种方式下载数据：

• 大多数数据（完整或部分）都可以作为CSV/TSV、RDF或XML文件在可下载数据部分.
• 获取包含搜索结果数据的XML、RDF和TAB文件形式的数据子集。使用位于搜索结果表标题最右侧的链接。
• 通过URL获取单个数据/图像条目作为一个基因的TSV、RDF或XML文件：例如https://www.proteinalas.org/ENSG00000121410.xml

特定细胞类型的蛋白质评分可在xml文件.

从人类蛋白质图谱保存或下载特定搜索结果的最佳方法是使用位于搜索结果列表表标题最右侧的TAB-file选项。

使用蛋白质图谱搜索可以找到特定蛋白质类的列表，例如预测的分泌蛋白质：protein_class：预测+分泌+蛋白质。然后，从搜索结果页面，您可以通过单击位于表标题最右侧的“tab”来下载作为选项卡分隔值的基因列表。

有一些方法可以下载图像（只有.jpg），所有这些都取决于您编写脚本或设置一些工具来解析我们在站点上提供的XML文件。

首先，按照可下载数据部分.亚细胞图像的图像链接位于subAssay/data/cellLine和subAssay/data/assayImage/imageUrl元素中每个抗体的元素。中的图像元素以其开启的通道命名，按顺序可能包括细胞核（蓝色）、微管（红色）、抗体（绿色）和内质网（黄色）。根据此命名方案，文件名中不包含切换的频道。

例子：
<imageUrl size=“large”>
   http://www.proteinalas.org/images/21616/193_D2_1_blue_red_green.jpg
</imageUrl>

不，不幸的是没有。提取信息的最简单方法可能是使用XML转换，例如XSLT。

RNA数据的TPM表可以在我们的下载页面.
由于GDPR立法，我们目前不提供原始格式的人体组织RNA-Seq数据。我们正在努力通过安全的联邦EGA存储库提供原始RNA-Seq数据，在该存储库中可以管理访问。然而，这方面的时间表尚不确定。

是的，请看许可证和引文页面了解详细信息。

不幸的是，可用数据已经在主页上列出（性别、年龄、诊断和等级，如果已知），并且由于所有材料都是匿名的，因此不可能找到比我们已经显示的信息更多的信息。

我们在仔细整理数据的基础上定期更新人类蛋白质图谱。除其他外，治疗还包括删除不符合我们质量标准的数据/抗体/图像。如果可能，我们将用更新的改进版本替换数据/抗体或图像。

请访问发布历史记录找出您感兴趣的抗体在哪个版本中被删除，或者旧图像被更新的图像替换。您可以通过在web浏览器中键入vX.proteinatras.org访问早期版本的人类蛋白质图谱，并将X替换为与您相关的版本。

首先查看“抗体/抗原”标签中使用的抗体；提供者和产品名称列在那里，按照提供者链接并搜索产品名称（HPA抗体直接链接）。

是的，您可以下载这两种协议国际水文委员会和国际单项体育联合会.

可靠性得分指南针对每个子地图集。您可以阅读更多关于组织图谱指南的信息在这里和细胞图谱在这里可靠性评分基于与内部RNA-seq数据的一致性、外部来源（UniprotKB/Swiss-Prot）的支持以及独立抗体之间的染色模式相似性。

蛋白质表达评分基于人工根据染色强度（阴性、弱、中等或强）和染色细胞分数（<25%、25-75%或>75%）对免疫组化数据进行评分。强度和分数的每个组合都会自动转换为蛋白质表达水平分数，如下所示：阴性-未检测到；弱<25%-未检测到；弱结合25-75%或75%低；中度<25%-低；中度联合25-75%或75%-中度；强<25%-中等，强结合25-75%或75%-高。除此之外，当我们的专家注释器进行评估时，蛋白质表达值会根据需要进行手动调整。有关基于知识的注释的更多信息，请参阅分析和注释部分.

“primary data page”（主要数据页）上提供了每个基因的免疫组织化学主要数据的综合摘要，例如。https://www.proteinalas.org/ENSG00000254647-INS/tissue/primary网站+数据

图谱上的图像是显示每个抗体免疫组织化学染色的原始数据。表达分数描述了基于知识的真实蛋白质表达的最佳估计。这意味着专家已经手动分析了所有图像，并评估染色是否可能是真正的蛋白质表达。如果专家确定所看到的染色不是真正的蛋白质表达，分数将设置为“未检测到”。

有关抗体染色注释的更多信息，请参阅分析和注释部分免疫组织化学-组织：注释.

有关基于知识的蛋白质表达注释的更多信息，请参阅分析和注释部分免疫组织化学-组织：基于知识的注释.

是的，允许在出版物和演示中使用人类蛋白质图谱中的数据和图像，只要执照和引文满足条件。

请引用我们在数据使用策略.

不，我们不是。

我们通常每年发布1-2次新数据，并尽最大努力继续探索未标记的目标。所有基因都有一般的基因信息和RNA表达数据。如果您对特定基因有疑问，请发送电子邮件contact@proteinalas.org我们可能会告诉你是否有任何未公布的结果。

• 胃1和胃2、子宫内膜1和子宫内膜2、软组织1和2：
对于这些组织1和2来说，简单地说，不是通常的三个样本，而是六个样本（2x3）。对于胃和子宫内膜，与仅使用三个样本相比，六个样本使我们能够在更大程度上绘制胃不同部位和月经周期不同阶段子宫内膜样本的变化。由于此处注释的细胞类型通常很难取样，因此有两组软组织，并且具有六个核心而不是三个核心增加了包含尽可能多的细胞类型的可能性。


• 皮肤1和皮肤2：
皮肤1和皮肤2之间存在差异：皮肤1包含暴露在阳光下的皮肤，而皮肤2包含来自外阴或肛门区域的皮肤样本。我们分析了皮肤1的三个样品和皮肤2的三个样本。

原始组织样本并非来自健康个体；它们来自一个含有病人资料的生物银行。我们分析中使用的样本部分主要来自于从癌症患者身上切除的病理组织周围的正常组织。在我们从生物银行收集这些样本后，由一位认证的病理学家对其进行仔细检查，以确保根据组织学将其归类为正常。这意味着所显示的图像在组织学上是正常的，但在许多情况下，它们是在病变区域附近采样的。

Kaplan-Meier图显示了不同时间点的存活概率，例如，患病时存活5年的概率。该图描述了一开始，即在时间点0，100%的患者存活。随着时间的推移，随着每次死亡，存活的患者数量减少，导致曲线下降。这反过来意味着，随着每次死亡，剩余患者的生存概率降低。因此，那些活了10年的患者比那些活了5年的患者存活的概率更低。为了观察某个基因的表达是否影响生存率，患者材料被分为两组，高表达或低表达。如果一个基因是不利的，表达量最高的组存活率较低，即曲线会提前下降。关于卡普兰-迈尔曲线的更多信息，包括概率是如何计算的，我们建议文章

请阅读抗体提交部分有关如何提交抗体的详细信息。如果您有任何其他问题，请发送电子邮件contact@proteinalas.org

是的，欢迎研究人员和研究团队提交他们的内部抗体进行测试。如果正在准备基于结果的出版物，学术合作者也可以要求在公共人类蛋白质图谱门户网站上延迟发布数据和图像。该决定将由人类蛋白质图谱优先委员会作出，通常不会批准超过一年。