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使用来自HGNC公司和合奏以及人类蛋白质图谱项目的预测。
官方基因符号,通常是基因名称的缩写,根据HGNC公司。
完整基因名称依据HGNC公司。
为编码蛋白指定HPA蛋白类别。
基于信号肽和跨膜区域的预测方法,对所有基因的所有转录物进行了相应蛋白质的位置分析。
注释的位置否决了预测的位置,因此编码已注释为细胞内的预测分泌蛋白的基因将以细胞内为最终位置。
基因中的蛋白质编码转录物数量,定义如下合奏。
基于人类蛋白质图谱项目中产生的数据的RNA表达和蛋白质定位总结。
中编码蛋白的主要亚细胞位置和可靠性得分人类细胞。主要位置的特征可能是存在于所有受试细胞系中和/或与潜在额外位置相比染色强度更高。如果可用,还提供了Reactome中过度表达分析的链接,Reactomes是一个免费、开源、精选和同行审查的生物途径数据库。对蛋白质组的相应基因集进行了分析,分别定位于该页面上蛋白质的主要位置和附加位置。
无法使用的
编码蛋白亚细胞位置的总体基因可靠性得分。该分数表示基于与UniProtKB/Swish Prot数据库中可用的实验基因/蛋白质表征数据的一致性以及用于免疫细胞化学的抗体验证分析的存在的注释蛋白质定位的可靠性水平。
细胞图谱中提供的不同分析数据的链接。单击微型图像可直接进入相应的部分。
不同组织中RNA表达水平概述细胞系在人类蛋白质图谱中分析。HPA中产生的RNA测序结果报告为每百万标准化转录物(nTPM)值。在人类蛋白质图谱中,nTPM值1.0被定义为相应蛋白质表达的阈值。细胞系根据其在人体内的来源分为彩色编码组。通过单击右上角的工具栏,可以按不同标准对图表中的细胞系进行排序:获得细胞系的器官和来源,细胞系的类别纤维龙,按字母顺序或RNA表达下降。将鼠标悬停在图表中相应的栏上,可以访问有关特定单元格行的详细信息。