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使用来自HGNC公司和合奏以及人类蛋白质图谱项目的预测。
官方基因符号,通常是基因名称的缩写,根据HGNC公司.
完整基因名称依据HGNC公司.
基于信号肽和跨膜区域的预测方法,对所有基因的所有转录物进行了相应蛋白质的位置分析。
注释位置推翻了预测位置,因此编码已注释为细胞内的预测分泌蛋白的基因将以细胞内为最终位置。
基因中的蛋白质编码转录物数量,定义如下合奏。
基于人类蛋白质图谱项目中产生的数据的RNA表达和蛋白质定位总结。
基因可以在一个或多个组织中的不同细胞类型中具有丰富的特异性,也可以在许多不同组织中出现的核心细胞类型中富集。
RNA特异性类别基于基于正常组织scRNA-seq数据分析的细胞类型中的mRNA表达水平。这些类别包括:细胞类型富集、组富集、细胞类型增强、低细胞类型特异性和未检测到。
基于UniProt蛋白存在性的基因证据评分(UniProt证据);neXtProt蛋白存在(neXtProt证据);以及基于人类蛋白图谱抗体或RNA的评分(HPA证据)。可用分数为蛋白质水平的证据、转录水平的证据,无证据或不可用。
组织细胞类型部分为所有蛋白质编码基因提供了细胞类型特异性预测。可以找到有关可用数据的更多信息在这里以及分析说明在这里。
核心细胞类型表显示了在许多组织中发现的八种细胞类型的面板的数据。 彩色圆点表示所选基因在所示组织中具有核心细胞类型特异性。灰点表示该组织中存在细胞类型,但预计所选基因不会在那里富集。
该图显示了所选基因在异形组织中发现的所有非核心细胞类型中的富集分数,从而可以比较不同组织中的不同细胞类型。 放大的符号表示该基因被归类为相应细胞类型中丰富的细胞类型。
图中显示了所选基因在每个细胞类型、每个组织中的富集分数。放大的符号表示该基因被归类为相应细胞类型中丰富的细胞类型。