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使用来自HGNC公司和合奏以及人类蛋白质图谱项目的预测。
官方基因符号,通常是基因名称的缩写,根据HGNC公司.
完整基因名称依据HGNC公司.
基于信号肽和跨膜区预测方法,对所有基因的所有转录物进行了相应蛋白质的位置分析。
注释的位置否决了预测的位置,因此编码已注释为细胞内的预测分泌蛋白的基因将以细胞内为最终位置。
来自基因的蛋白质编码转录物的数量,定义如下合奏。
基于人类蛋白质图谱项目中产生的数据的RNA表达和蛋白质定位总结。
中编码蛋白的主要亚细胞位置和可靠性得分人类细胞。主要位置的特征可能是存在于所有受试细胞系中和/或与潜在额外位置相比染色强度更高。如果可用,还提供了Reactome中过度表达分析的链接,Reactomes是一个免费、开源、精选和同行审查的生物途径数据库。对蛋白质组的相应基因集进行了分析,分别定位于该页面上蛋白质的主要位置和附加位置。
定位于核质(支持)、细胞质(支持)
编码蛋白亚细胞位置的总体基因可靠性得分。分数表示基于与UniProtKB/Swiss-Prot数据库中可用实验基因/蛋白质特征数据的一致性以及免疫细胞化学抗体验证分析的存在,注释蛋白质定位的可靠性水平。
用于此检测的抗体。点击抗体了解更多信息。
Cell Atlas中提供了不同分析数据的链接。单击微型图像可直接进入相应的部分。
不同组织中RNA表达水平概述细胞系在人类蛋白质图谱中分析。HPA中生成的RNA-测序结果报告为标准化百万分之转录物(nTPM)值。在人类蛋白质图谱中,nTPM值1.0被定义为相应蛋白质表达的阈值。细胞系根据其在人体内的来源分为彩色编码组。通过单击右上角的工具栏,可以按不同标准对图表中的细胞系进行排序:获得细胞系的器官和来源,细胞系的类别纤维龙,按字母顺序或RNA表达下降。将鼠标悬停在图表中相应的栏上,可以访问有关特定单元格行的详细信息。
通过以下方法测定人类细胞中编码蛋白的亚细胞位置的分析间接免疫荧光和共焦显微镜.基于抗体的染色通常在U2OS和两个额外的细胞系中进行,根据RNA表达选择。下面显示了以绿色显示感兴趣蛋白质的典型多色图像。这些图像还包括细胞核标记(蓝色)、微管标记(红色)和ER标记(黄色)。所有图像都可以单击以获得放大视图。有关单元格结构参考,请访问单元格字典.
基于所有研究细胞系和所有测试抗体的免疫荧光分析的亚细胞定位总结。
中编码蛋白的主要亚细胞位置和可靠性得分人类细胞主要位置可以通过在所有测试的细胞系中的存在和/或与潜在的附加位置相比更高的染色强度来表征。
用于打开和关闭多色图像中不同频道的按钮。强度切换以16种不同颜色显示选定通道的像素强度范围。对象切换显示HPA项目中用于进一步分析的单元格的计算分段。对于根据相关性分析建议蛋白质的细胞周期依赖性的样本,使用对象切换时会显示每个细胞的预测细胞周期位置。
所有可用图像的缩影。复选框可用于选择要在上述窗口中比较的三个图像。所有图像都可以单击以获得放大视图。所选图像将以大尺寸和微型图像显示,该基因的所有其他染色结果将列在图像的左上角。选定的微型图像具有橙色覆盖。
用于分析的抗体。单击抗体ID链接到抗体验证页面。
用于分析的细胞系。阅读有关细胞系在人类蛋白质图谱中。
基于标准化RNA测序数据的细胞系中的RNA表达水平。数值大于1NX的基因被认为是表达的。
观察到的亚细胞位置。
观察到染色模式中的单细胞变化。蛋白质表达水平的变化可以通过免疫荧光信号强度的变化来观察,而空间变化可以通过蛋白质的亚细胞分布变化来观察。
在用于表征的附加测定中观察到的RNA和/或蛋白质表达的观察到的单细胞变化的细胞周期依赖性单细胞变异.